More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1101 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
385 aa  755    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  55.05 
 
 
415 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.54 
 
 
428 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  60.3 
 
 
411 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  54.86 
 
 
402 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  58.38 
 
 
391 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  58.41 
 
 
424 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  51.39 
 
 
406 aa  362  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  50.63 
 
 
408 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  51.26 
 
 
411 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  55.75 
 
 
396 aa  358  7e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.85 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.1 
 
 
415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  50.38 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  54.25 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  52.24 
 
 
397 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  52.24 
 
 
383 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  51.83 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  51.83 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.73 
 
 
405 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.15 
 
 
410 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.55 
 
 
401 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  52.79 
 
 
397 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  51.43 
 
 
375 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  48.48 
 
 
418 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  47.66 
 
 
420 aa  330  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  50.68 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.15 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  50 
 
 
372 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.53 
 
 
387 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  51.35 
 
 
392 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  48.83 
 
 
384 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.61 
 
 
416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  48.26 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  48.21 
 
 
376 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  47.92 
 
 
376 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  47.76 
 
 
362 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  46.87 
 
 
370 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  46.41 
 
 
353 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  46.55 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  47.02 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  46.57 
 
 
366 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  49.12 
 
 
381 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  49.12 
 
 
381 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.73 
 
 
478 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  50.17 
 
 
476 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  44.9 
 
 
395 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.66 
 
 
389 aa  265  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  45.05 
 
 
392 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  45.18 
 
 
392 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  48.48 
 
 
476 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  48.15 
 
 
476 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  45.97 
 
 
351 aa  259  8e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  44.67 
 
 
377 aa  258  9e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  43.2 
 
 
331 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  46.43 
 
 
472 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
386 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  43.32 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  43.49 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.15 
 
 
471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  47.6 
 
 
474 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  44.15 
 
 
459 aa  250  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  44.15 
 
 
459 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  45.67 
 
 
464 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  48.45 
 
 
388 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  43.58 
 
 
380 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.62 
 
 
466 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.26 
 
 
479 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.95 
 
 
386 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  40.52 
 
 
383 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  44.77 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  45.66 
 
 
502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  46.26 
 
 
491 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  38.73 
 
 
373 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.17 
 
 
384 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.09 
 
 
500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  45.8 
 
 
484 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  46.62 
 
 
514 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  48.94 
 
 
498 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  41.35 
 
 
373 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  47.02 
 
 
503 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  40.9 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  39.62 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  41.21 
 
 
504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.93 
 
 
467 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  40.96 
 
 
514 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  45.94 
 
 
479 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  44.85 
 
 
481 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  47.2 
 
 
453 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  45.42 
 
 
485 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  46.98 
 
 
462 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  45.42 
 
 
502 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  45.42 
 
 
502 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.98 
 
 
464 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.83 
 
 
473 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  45.42 
 
 
461 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  45.42 
 
 
502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  45.42 
 
 
502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  45.42 
 
 
502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>