More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1880 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
386 aa  770    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  53.91 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.03 
 
 
386 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  53.12 
 
 
369 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.09 
 
 
381 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  50.27 
 
 
379 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
375 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  44.16 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.91 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  41.6 
 
 
415 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  47.68 
 
 
474 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  44.54 
 
 
452 aa  279  7e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.91 
 
 
408 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.6 
 
 
408 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.27 
 
 
478 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  40.3 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  46.06 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  46.08 
 
 
500 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.04 
 
 
464 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  45.19 
 
 
424 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  42.69 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.02 
 
 
476 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
428 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  44.67 
 
 
459 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  44.38 
 
 
459 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.45 
 
 
482 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  45.03 
 
 
472 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.67 
 
 
476 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  41.41 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  45.02 
 
 
506 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  42.9 
 
 
391 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.56 
 
 
411 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  41.25 
 
 
383 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.16 
 
 
476 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.16 
 
 
383 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.42 
 
 
385 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  40.66 
 
 
396 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.27 
 
 
473 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.94 
 
 
481 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  44.34 
 
 
453 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  44.48 
 
 
411 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.33 
 
 
471 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.75 
 
 
466 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.84 
 
 
475 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.51 
 
 
485 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.17 
 
 
464 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.31 
 
 
476 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.76 
 
 
457 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  45.54 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  44.41 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.42 
 
 
480 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  44.35 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.81 
 
 
498 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  42.99 
 
 
402 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  42.99 
 
 
402 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  43.06 
 
 
385 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  43.88 
 
 
504 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.14 
 
 
415 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  43.67 
 
 
393 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.13 
 
 
464 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  39.49 
 
 
420 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 
401 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.29 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.19 
 
 
474 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  41.69 
 
 
383 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.54 
 
 
505 aa  245  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.48 
 
 
474 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.37 
 
 
458 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.2 
 
 
503 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.92 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.28 
 
 
502 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  42.69 
 
 
404 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
401 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 
401 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.44 
 
 
398 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.51 
 
 
405 aa  242  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40.83 
 
 
503 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
379 aa  242  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  42.69 
 
 
404 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.18 
 
 
479 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.11 
 
 
505 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.72 
 
 
503 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.02 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.82 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  41.82 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.82 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.84 
 
 
469 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  37.47 
 
 
407 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.12 
 
 
513 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  43.65 
 
 
385 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  37.47 
 
 
407 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.61 
 
 
477 aa  239  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.61 
 
 
477 aa  239  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  43.36 
 
 
478 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 
385 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.45 
 
 
502 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.52 
 
 
401 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  45.36 
 
 
494 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  45.36 
 
 
493 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>