More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0372 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 377 aa  729    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  73.96 
 
 		 351 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  65.16 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  58.48 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  58.48 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  58.16 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  48 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  47.26 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  47.89 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  47.55 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  47.75 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  48.92 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  46.69 
 
 		 376 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  46.59 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  46.4 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  46.85 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  47.92 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  44.72 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  45.27 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  44.18 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  46.11 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.63 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  45.35 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  45.58 
 
 		 415 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  45.35 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  45.86 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  44.13 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  46.96 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  46.96 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  44.81 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  43.66 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  43.84 
 
 		 401 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  43.66 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.65 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 405 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  44.05 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  44.32 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.48 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.88 
 
 		 428 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  44.67 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 		 405 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  43.04 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  41.24 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  41.24 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  42.53 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  41.81 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  43.32 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  42.9 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.94 
 
 		 415 aa  242  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  42.86 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.43 
 
 		 461 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  39.75 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  40.41 
 
 		 420 aa  228  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  39.76 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.16 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  39.73 
 
 		 474 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  39.73 
 
 		 474 aa  225  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  40.06 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.97 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.87 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  41.98 
 
 		 488 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.67 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.66 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  39.2 
 
 		 476 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.66 
 
 		 499 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  42.09 
 
 		 492 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  42.09 
 
 		 492 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  42.59 
 
 		 468 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.82 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.68 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.8 
 
 		 491 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.68 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.87 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.68 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.68 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.87 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.87 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.12 
 
 		 478 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.44 
 
 		 459 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.73 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  37.98 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  37.98 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  37.98 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.44 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  41.34 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.3 
 
 		 452 aa  216  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  39.05 
 
 		 495 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.75 
 
 		 500 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.43 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.94 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  40.88 
 
 		 464 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.6 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.39 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  41.56 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  40.49 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  42.09 
 
 		 520 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>