More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0600 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
353 aa  685    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  86.76 
 
 
366 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  77.45 
 
 
362 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  64.9 
 
 
376 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  68.73 
 
 
370 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  68.45 
 
 
376 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  67.56 
 
 
376 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  69.64 
 
 
376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  66.18 
 
 
381 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  66.18 
 
 
381 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  52.79 
 
 
406 aa  341  9e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  51.59 
 
 
396 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  50.43 
 
 
411 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.01 
 
 
405 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  48.86 
 
 
383 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  48.86 
 
 
397 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  50 
 
 
394 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  49.17 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.55 
 
 
410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.8 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  50.29 
 
 
351 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  48.97 
 
 
377 aa  298  7e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  47.18 
 
 
380 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  44.64 
 
 
415 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  46.41 
 
 
385 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  45.59 
 
 
424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  46.72 
 
 
397 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.37 
 
 
428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  45.35 
 
 
392 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  45.86 
 
 
392 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  45.95 
 
 
411 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  43.7 
 
 
383 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  43.9 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  43.19 
 
 
373 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  43.36 
 
 
418 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  43.75 
 
 
402 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  43.45 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  45.35 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  43.81 
 
 
408 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  43.02 
 
 
373 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  43.48 
 
 
357 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  44.48 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  43.82 
 
 
402 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  45.05 
 
 
392 aa  268  8e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  43.82 
 
 
402 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  46.55 
 
 
384 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.91 
 
 
387 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 
405 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.35 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.17 
 
 
416 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  39.88 
 
 
401 aa  248  9e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.17 
 
 
415 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  43.2 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.41 
 
 
476 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.7 
 
 
478 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.91 
 
 
457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 
472 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  40.99 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.94 
 
 
513 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.76 
 
 
471 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 
381 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.89 
 
 
389 aa  229  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.12 
 
 
500 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  41.4 
 
 
382 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.65 
 
 
476 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  42.09 
 
 
492 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.18 
 
 
476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.73 
 
 
458 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.18 
 
 
476 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  38.58 
 
 
459 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.86 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.42 
 
 
466 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  38.58 
 
 
459 aa  222  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.84 
 
 
385 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.66 
 
 
464 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.49 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 
479 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  39.1 
 
 
396 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.35 
 
 
461 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  40.35 
 
 
471 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  39.66 
 
 
504 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  42.31 
 
 
412 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  40.64 
 
 
471 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  35.98 
 
 
453 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  42.24 
 
 
495 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.72 
 
 
462 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.77 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  39.48 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.21 
 
 
465 aa  216  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.46 
 
 
398 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  39.48 
 
 
488 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.46 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
412 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  42.57 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4151  predicted protein  44.63 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.62 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.6 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  40.06 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>