More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3025 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  88.35 
 
 		 412 aa  690    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  100 
 
 		 413 aa  792    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  62.72 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  48.63 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  42.44 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  47.68 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.46 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  47.44 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.36 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  43.43 
 
 		 506 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  41.47 
 
 		 473 aa  233  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  43.11 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  39.04 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.5 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  44.04 
 
 		 453 aa  229  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  37.99 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.22 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  41.69 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  42.42 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  40.27 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.48 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  42.94 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  44.18 
 
 		 511 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.06 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.64 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.64 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.69 
 
 		 502 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.49 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.64 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.32 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  41.11 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.34 
 
 		 502 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.55 
 
 		 535 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  45.62 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.07 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  43.11 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.82 
 
 		 459 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.03 
 
 		 505 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 381 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  40.96 
 
 		 418 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  40.49 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  46.4 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.11 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.97 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  41.21 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  41.74 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  42.98 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  40.76 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  44.01 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  39.88 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  38.01 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.23 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.72 
 
 		 478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  40.77 
 
 		 455 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  40.22 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.18 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  40.5 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.39 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  40.5 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.24 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  40.5 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.6 
 
 		 471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  40.1 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.77 
 
 		 502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.77 
 
 		 502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  41.36 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  44.91 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.77 
 
 		 485 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.9 
 
 		 474 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  43.73 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  41.08 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  41.06 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  47.27 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.34 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  40.06 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.55 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.42 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.12 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  40.06 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  47.1 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  36.94 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  36.94 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  47.27 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.29 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  41.79 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  43.01 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  37.87 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>