More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2119 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  83.97 
 
 		 418 aa  706    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  100 
 
 		 418 aa  816    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  52.24 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  49.44 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  46.02 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  44.83 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  44.95 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  46.94 
 
 		 381 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.88 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  45.27 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.76 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.17 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.59 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.58 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.92 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  42.64 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  42.01 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.12 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  43.95 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.19 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.89 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.03 
 
 		 471 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  42.48 
 
 		 383 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  41.94 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  42.18 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  39.22 
 
 		 413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.83 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  41.12 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.06 
 
 		 476 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  36.91 
 
 		 472 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.07 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  41.08 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  41.89 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  41.15 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.41 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.21 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.28 
 
 		 513 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.46 
 
 		 367 aa  207  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  34.53 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  39.88 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  34.92 
 
 		 502 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  37.93 
 
 		 396 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.53 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.67 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.75 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.54 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.47 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.5 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  37.06 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.45 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.99 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.09 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.41 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.07 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  42.73 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  39.54 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.37 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  44.44 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.53 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.72 
 
 		 511 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  36.22 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  42.35 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1143  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.25 
 
 		 348 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.81 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.13 
 
 		 528 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.65 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  41.2 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.32 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 		 366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  41.38 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  35.46 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  37.87 
 
 		 517 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.96 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  36.34 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  44.3 
 
 		 376 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  39.73 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.6 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  37.54 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.74 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  37.54 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.32 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  41.24 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  38.42 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  38.44 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.18 
 
 		 483 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  40.07 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  37.46 
 
 		 520 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.18 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 397 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  44.71 
 
 		 508 aa  193  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  37.98 
 
 		 465 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  36.64 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.33 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>