More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0718 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
424 aa  831    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  39.85 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.94 
 
 
421 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  40.45 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  40.2 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.01 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  33.84 
 
 
363 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  33.84 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.28 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  39.43 
 
 
375 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  36.84 
 
 
513 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  40.68 
 
 
396 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.78 
 
 
446 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.32 
 
 
368 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  35.35 
 
 
483 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.35 
 
 
483 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.36 
 
 
504 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.15 
 
 
476 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  36.36 
 
 
456 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  36.68 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.69 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.9 
 
 
472 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.85 
 
 
464 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  36.36 
 
 
498 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  36.19 
 
 
483 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.6 
 
 
476 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  36.39 
 
 
471 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  38.83 
 
 
455 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  35.71 
 
 
503 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  37.8 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.57 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  35.99 
 
 
399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.62 
 
 
366 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.08 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  36.57 
 
 
578 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.1 
 
 
480 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  37.2 
 
 
473 aa  184  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.24 
 
 
511 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.87 
 
 
476 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  35.45 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  36.69 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  35.05 
 
 
471 aa  182  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.63 
 
 
388 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  36.67 
 
 
388 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  36.84 
 
 
400 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  36.42 
 
 
588 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  35.35 
 
 
502 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  36.73 
 
 
374 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.53 
 
 
453 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  36.13 
 
 
481 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  35.03 
 
 
504 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  37.5 
 
 
457 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  33.93 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.66 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.14 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  32.25 
 
 
517 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  34.77 
 
 
511 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  37.05 
 
 
471 aa  180  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.87 
 
 
484 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  36.62 
 
 
509 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  37.82 
 
 
374 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 
428 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  39.84 
 
 
511 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  38.18 
 
 
383 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  39.18 
 
 
498 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  36.24 
 
 
453 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  38.18 
 
 
383 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  32.77 
 
 
473 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  38.36 
 
 
344 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  36.23 
 
 
473 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.79 
 
 
502 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  38.48 
 
 
511 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  38.18 
 
 
384 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  37.85 
 
 
508 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  36.76 
 
 
365 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  34.34 
 
 
496 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.42 
 
 
386 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  38.48 
 
 
511 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  39.06 
 
 
464 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.44 
 
 
456 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  37.92 
 
 
383 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.17 
 
 
535 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 
464 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.23 
 
 
478 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.11 
 
 
476 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  37.4 
 
 
391 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.07 
 
 
450 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  38.07 
 
 
379 aa  176  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.17 
 
 
466 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  36.07 
 
 
450 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  36.07 
 
 
450 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  33.59 
 
 
474 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  35.32 
 
 
374 aa  176  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  35.47 
 
 
464 aa  176  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.68 
 
 
412 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  35.68 
 
 
492 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.23 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>