More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1396 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 372 aa  739    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  56.23 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  53.78 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  50.95 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.35 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  50.55 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  52.11 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.46 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  53.71 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.12 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  53.41 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  53.12 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  51.25 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  52.23 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.91 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.61 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  46.91 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.76 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  51.56 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  53.12 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.98 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  45.72 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  47.77 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  49.38 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  45.31 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  45 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  44.97 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.5 
 
 		 375 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  50.76 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  52.53 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.79 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  47.73 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  52.22 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.07 
 
 		 399 aa  248  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.82 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  48.52 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  42.94 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.43 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  43.58 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.64 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.55 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.75 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.53 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  40.67 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  35.6 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  41.49 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.91 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.52 
 
 		 511 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.56 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.31 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.79 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.81 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  37.03 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.69 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.61 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.46 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.25 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  38.21 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.11 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  39.4 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.11 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.84 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  38.6 
 
 		 535 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.07 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.52 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  35.61 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  40 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.68 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.39 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  39.01 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.88 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.89 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.89 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  38.66 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.21 
 
 		 476 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.3 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  36.36 
 
 		 539 aa  196  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.12 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.14 
 
 		 453 aa  195  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.23 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.23 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  39.71 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.23 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.29 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.94 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.94 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.17 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  37.29 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.35 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.35 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  42.01 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.81 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.83 
 
 		 474 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.09 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  41.67 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.11 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>