More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0382 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 377 aa  747    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  68.75 
 
 		 383 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  68.75 
 
 		 383 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  68.25 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  67.95 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  67.56 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  64.58 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  64.44 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  61.49 
 
 		 374 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  57.23 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  56.89 
 
 		 374 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  56.04 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.51 
 
 		 372 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  50 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  50.14 
 
 		 375 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  50.45 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.18 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  48.4 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.99 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.45 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.74 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.38 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  49.28 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  49.28 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.06 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  49 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  48.1 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  47.11 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  44.77 
 
 		 466 aa  246  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  45.9 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  41.74 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  40.4 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  39.94 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  39.63 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.17 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.69 
 
 		 366 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.12 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  40.59 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  41.03 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 		 387 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  42.73 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.19 
 
 		 473 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  41.35 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  36.93 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  45.49 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.01 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.31 
 
 		 511 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  42.51 
 
 		 474 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  42.51 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.42 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  43.55 
 
 		 496 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  43.46 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  43.46 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  43.46 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  43.46 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  43.46 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  41.85 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.7 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  41.21 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  42.16 
 
 		 474 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  39.53 
 
 		 492 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  39.53 
 
 		 492 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.75 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  41.81 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  40.97 
 
 		 456 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  40.74 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  45.23 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  35.68 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  44.33 
 
 		 450 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.4 
 
 		 455 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  40 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  40.3 
 
 		 457 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.43 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  41.58 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  42.18 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.3 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  43.62 
 
 		 451 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.26 
 
 		 450 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.12 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  36.69 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  41.26 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.38 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.26 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.26 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  36.45 
 
 		 413 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  40.77 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.38 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.38 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.62 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.65 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  38.06 
 
 		 420 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.01 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>