More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1725 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  100 
 
 		 374 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  64.63 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  66.01 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.73 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  63.03 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  63.2 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  63.2 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  60.22 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.49 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  53.74 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  57.58 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  56.17 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.63 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  50.3 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 		 383 aa  301  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  49.85 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.08 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  47.56 
 
 		 376 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.82 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  47.73 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  43.3 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.51 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  48.8 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  48.8 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.25 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  48.8 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.59 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  47.34 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  47.55 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  41.23 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  40.92 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  44.31 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.82 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.57 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  40.12 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.23 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  42.55 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.41 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  41.52 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.64 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.24 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.49 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  40.77 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  40.19 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.01 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.21 
 
 		 423 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  43.66 
 
 		 492 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  39.66 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.9 
 
 		 535 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  44.19 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  40.06 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.7 
 
 		 493 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.7 
 
 		 493 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.69 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  41.34 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  41.64 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  42.05 
 
 		 494 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  41.7 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  42.05 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  41.44 
 
 		 456 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.47 
 
 		 511 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  41.99 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  41.99 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  41.99 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  41.99 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  41.99 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.85 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  41.99 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.85 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  41.99 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  33.66 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.9 
 
 		 483 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.31 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  41.55 
 
 		 491 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  40.99 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  39.76 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.48 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.14 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.36 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.54 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  43.23 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  42.31 
 
 		 491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  44.41 
 
 		 511 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.81 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.26 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.65 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.36 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.04 
 
 		 396 aa  189  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  40.14 
 
 		 504 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.14 
 
 		 502 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.14 
 
 		 502 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.1 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.14 
 
 		 502 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  42.16 
 
 		 503 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.4 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.14 
 
 		 502 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.14 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  41.46 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.14 
 
 		 502 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>