More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4575 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 375 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  88.27 
 
 		 375 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  69.5 
 
 		 376 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  70.79 
 
 		 381 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  70.79 
 
 		 381 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  70.79 
 
 		 381 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.81 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.76 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.03 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  58.49 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  50.27 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  52.84 
 
 		 374 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  48.66 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  48.53 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.59 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  48.2 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  47.72 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  47.56 
 
 		 469 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  47.72 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  48.52 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.35 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  49.85 
 
 		 374 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  49.18 
 
 		 365 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.99 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.23 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  48.8 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  41.06 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  43.95 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  40.56 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  40.56 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  41.49 
 
 		 374 aa  228  9e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  44.41 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.05 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  37.86 
 
 		 379 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.98 
 
 		 399 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.34 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.92 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  39.48 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  46.6 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.18 
 
 		 478 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.28 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  40.7 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.47 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.19 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.59 
 
 		 511 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  35.69 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.95 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.55 
 
 		 385 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.39 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38 
 
 		 467 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.32 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  35.87 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  39.94 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.98 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.74 
 
 		 473 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.83 
 
 		 588 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.59 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  35.99 
 
 		 479 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  37.43 
 
 		 467 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.8 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.39 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.77 
 
 		 479 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.9 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.9 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.63 
 
 		 459 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  37.71 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  38.08 
 
 		 492 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  39.61 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.88 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  38.74 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  38.33 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  38.33 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  36.13 
 
 		 492 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.22 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.49 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35 
 
 		 456 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  38.83 
 
 		 578 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.13 
 
 		 477 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.93 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.47 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  36.51 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  36.13 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.06 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.07 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  40.73 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.07 
 
 		 508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  37.46 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.12 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  38.24 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  37.46 
 
 		 476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  36.41 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  38.73 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  33.33 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.11 
 
 		 487 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.75 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.13 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  32.88 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>