More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1750 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  100 
 
 		 418 aa  821    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  86.22 
 
 		 418 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  54.46 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  46.28 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  45.07 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  49.03 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  45.05 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  44.54 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  42.45 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.88 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.79 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  44.08 
 
 		 375 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.27 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.59 
 
 		 476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.05 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.68 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.45 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  41.1 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.26 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.89 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.78 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.9 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  42.9 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.42 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  45.24 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  39.75 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.78 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  41.64 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.77 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  41.37 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  38.3 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.87 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  41.07 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.86 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  41.07 
 
 		 383 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.27 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.94 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.78 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.21 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.81 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  41.02 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.25 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  40.45 
 
 		 365 aa  213  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.27 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.45 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.61 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.14 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.59 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.57 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.26 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.94 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.07 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.53 
 
 		 535 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  38.06 
 
 		 396 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  40.05 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  44.83 
 
 		 504 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.46 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.2 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.75 
 
 		 464 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  37.4 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  42.35 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.59 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  39.45 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.67 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.59 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  38.54 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.08 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  38.54 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  40.79 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.3 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  42.06 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.75 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  40.8 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  39.31 
 
 		 492 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.38 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.54 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  46.58 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.31 
 
 		 511 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.67 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  36.97 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  39.8 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.12 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.91 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  36.97 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.36 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.91 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.37 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  36.78 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.58 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.14 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.07 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  45.19 
 
 		 505 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  39.14 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.41 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  45.64 
 
 		 376 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  38.13 
 
 		 520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  37.26 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  36.46 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>