More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4914 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4914  serine protease  100 
 
 		 374 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  59.13 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  58.86 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  58.74 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.58 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  58.58 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  58.42 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  57.58 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  52.88 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  52.39 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.89 
 
 		 377 aa  348  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  54.52 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.59 
 
 		 372 aa  319  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  57.1 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  50.27 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  50.59 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.81 
 
 		 383 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.26 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.77 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.6 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  50.54 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  50.54 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  48.51 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.06 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  50.53 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.96 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  44.82 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.15 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  45.35 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  46.63 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  45.77 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  41.94 
 
 		 466 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  42.86 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.04 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.57 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  38.57 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  42.11 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  39.12 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.4 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  38.95 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  41.21 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.92 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.98 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.99 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.69 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  43.33 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  39.68 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  41.69 
 
 		 511 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.89 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.88 
 
 		 446 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.16 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  38.78 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.58 
 
 		 453 aa  195  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  39.88 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.83 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  41.96 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  44.44 
 
 		 464 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  43.54 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  44.22 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.95 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.44 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.7 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.33 
 
 		 459 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.62 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  34.2 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.51 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.96 
 
 		 459 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  44.48 
 
 		 485 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.48 
 
 		 500 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  44.52 
 
 		 491 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.31 
 
 		 488 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  42.65 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  39.66 
 
 		 492 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  39.66 
 
 		 492 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.55 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  39.66 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  39.39 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  43.84 
 
 		 525 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  39.79 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  39.18 
 
 		 501 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.1 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.46 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  42.01 
 
 		 496 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  39.26 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.86 
 
 		 508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  39.37 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.72 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.72 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  39.34 
 
 		 508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  44.48 
 
 		 485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.75 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  39.18 
 
 		 474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.97 
 
 		 467 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.46 
 
 		 511 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.89 
 
 		 492 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  42.47 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  41.05 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  38.94 
 
 		 504 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>