More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2308 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  95.05 
 
 
384 aa  727    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  100 
 
 
383 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  97.13 
 
 
383 aa  744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  91.64 
 
 
384 aa  700    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  97.91 
 
 
383 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  64.5 
 
 
375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  68.46 
 
 
365 aa  457  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  68.75 
 
 
377 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  63.2 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  60.11 
 
 
374 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  53.3 
 
 
368 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.27 
 
 
372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  56.04 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  54.22 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  49.33 
 
 
375 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  48.28 
 
 
376 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.42 
 
 
383 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  49.61 
 
 
381 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  49.61 
 
 
381 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.87 
 
 
388 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  49.35 
 
 
381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.34 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  48.91 
 
 
399 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.09 
 
 
368 aa  272  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.14 
 
 
366 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 
375 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  45.61 
 
 
466 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  45.29 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  48.46 
 
 
374 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.5 
 
 
399 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.24 
 
 
366 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  42.94 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  41.18 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  39.83 
 
 
374 aa  233  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  42.82 
 
 
396 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  42.26 
 
 
368 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.37 
 
 
389 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.12 
 
 
425 aa  225  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  38.21 
 
 
379 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.37 
 
 
418 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  42.18 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  45.2 
 
 
467 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  39.64 
 
 
403 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  45.07 
 
 
511 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.78 
 
 
387 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  37.24 
 
 
381 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  44.91 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  44.56 
 
 
455 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  44.76 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.54 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.7 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  40 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  45.1 
 
 
455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  36.22 
 
 
398 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  38.81 
 
 
458 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  42.61 
 
 
492 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  42.61 
 
 
492 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  44.14 
 
 
489 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  41.64 
 
 
457 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.8 
 
 
453 aa  195  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  35.88 
 
 
453 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.62 
 
 
379 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  45.26 
 
 
451 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.81 
 
 
483 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.95 
 
 
398 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.99 
 
 
381 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  44 
 
 
492 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  43.86 
 
 
456 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.79 
 
 
385 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  42.96 
 
 
504 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  38.03 
 
 
413 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  42.86 
 
 
385 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  45.26 
 
 
450 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  45.26 
 
 
450 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  43.46 
 
 
514 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.4 
 
 
484 aa  193  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  45.26 
 
 
450 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.36 
 
 
459 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.07 
 
 
408 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.07 
 
 
408 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.36 
 
 
459 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.56 
 
 
450 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  41.72 
 
 
341 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.76 
 
 
483 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.76 
 
 
483 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.7 
 
 
396 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  43.46 
 
 
514 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.61 
 
 
535 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.9 
 
 
503 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  40.84 
 
 
379 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  34.78 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  44.06 
 
 
369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.63 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  42.86 
 
 
385 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  37.74 
 
 
400 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  41.9 
 
 
491 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  42.7 
 
 
500 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  44.21 
 
 
511 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.54 
 
 
474 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>