More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46875 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  100 
 
 
466 aa  945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.72 
 
 
372 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  47.28 
 
 
329 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.54 
 
 
383 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  45.59 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.99 
 
 
368 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  43.1 
 
 
368 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.01 
 
 
384 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  43.3 
 
 
374 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  45.66 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
375 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  45.61 
 
 
383 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  45.03 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  44.16 
 
 
384 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  45.03 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.54 
 
 
377 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  43.86 
 
 
344 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.94 
 
 
374 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.28 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  40.5 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  43.06 
 
 
376 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  40.17 
 
 
368 aa  231  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  41.97 
 
 
396 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  41.23 
 
 
399 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  37.68 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  37.39 
 
 
363 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.21 
 
 
387 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.34 
 
 
388 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.06 
 
 
375 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.07 
 
 
366 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  42.69 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  43.27 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  43.27 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  40.05 
 
 
418 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.96 
 
 
425 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  39.54 
 
 
418 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.75 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  40.06 
 
 
374 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.43 
 
 
389 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  40.46 
 
 
374 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.02 
 
 
452 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  35.89 
 
 
379 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  35.91 
 
 
400 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  34.73 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  33.51 
 
 
459 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.69 
 
 
467 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.62 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49223  predicted protein  38.53 
 
 
447 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.83 
 
 
384 aa  181  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  38.76 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.68 
 
 
483 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.68 
 
 
483 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 
426 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  34.93 
 
 
318 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.46 
 
 
480 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  34.99 
 
 
403 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  35.48 
 
 
413 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  32.55 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.84 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40 
 
 
476 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  35.06 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  35.33 
 
 
369 aa  173  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  33.42 
 
 
539 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.47 
 
 
473 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  36.51 
 
 
511 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  34.55 
 
 
535 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  32.75 
 
 
508 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38 
 
 
385 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.93 
 
 
482 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.69 
 
 
471 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.87 
 
 
380 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  36.91 
 
 
379 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.99 
 
 
407 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.55 
 
 
481 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.28 
 
 
423 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.2 
 
 
461 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  35.28 
 
 
471 aa  170  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  35.69 
 
 
341 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.22 
 
 
483 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  39.34 
 
 
472 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 
386 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.35 
 
 
476 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.61 
 
 
388 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  35.08 
 
 
386 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  36.84 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  35.39 
 
 
527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.03 
 
 
404 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  37.99 
 
 
451 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.98 
 
 
500 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  37.99 
 
 
451 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  36.63 
 
 
471 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.96 
 
 
476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  35.71 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  35.06 
 
 
527 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.03 
 
 
404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  31.83 
 
 
415 aa  166  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  34.91 
 
 
513 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  34.91 
 
 
513 aa  166  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>