More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1146 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  100 
 
 
374 aa  738    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  57.98 
 
 
379 aa  424  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  60.85 
 
 
381 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  45.07 
 
 
418 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  46.02 
 
 
418 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  43.69 
 
 
396 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  41.37 
 
 
400 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  47.44 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.03 
 
 
394 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  40.99 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 
366 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  41.84 
 
 
403 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  40.4 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  42.64 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  40.11 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  39.83 
 
 
383 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.11 
 
 
384 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  42.01 
 
 
368 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  42.86 
 
 
374 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.82 
 
 
372 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  39.39 
 
 
384 aa  229  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.36 
 
 
399 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  39.14 
 
 
344 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  43.3 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.54 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.52 
 
 
474 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.86 
 
 
474 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  41.52 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.98 
 
 
479 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.09 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  39.58 
 
 
375 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.24 
 
 
479 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.93 
 
 
492 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.79 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.32 
 
 
476 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.04 
 
 
387 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.93 
 
 
477 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.15 
 
 
476 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  38.89 
 
 
450 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.51 
 
 
457 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.78 
 
 
367 aa  215  9e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.44 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  44.01 
 
 
477 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.45 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  38.98 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.91 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.61 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.01 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.32 
 
 
511 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.35 
 
 
487 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.18 
 
 
502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.61 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  42.12 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.06 
 
 
500 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.33 
 
 
471 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.13 
 
 
465 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.94 
 
 
482 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.25 
 
 
474 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.14 
 
 
395 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.15 
 
 
471 aa  212  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.24 
 
 
513 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  37.94 
 
 
474 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  40.96 
 
 
578 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  37.94 
 
 
474 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.21 
 
 
476 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.19 
 
 
464 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.1 
 
 
458 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 
377 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  39.03 
 
 
451 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.32 
 
 
588 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.31 
 
 
462 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.52 
 
 
395 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.12 
 
 
485 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.07 
 
 
483 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.07 
 
 
483 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  38.69 
 
 
361 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  39.03 
 
 
451 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.46 
 
 
464 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40 
 
 
491 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.92 
 
 
408 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.72 
 
 
459 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.81 
 
 
479 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.62 
 
 
501 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.56 
 
 
472 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  40.75 
 
 
459 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 
366 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.83 
 
 
368 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.89 
 
 
511 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  40.42 
 
 
503 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 
511 aa  205  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 
381 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.2 
 
 
450 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.49 
 
 
505 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  41.84 
 
 
494 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  37.7 
 
 
365 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  37.2 
 
 
450 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  37.2 
 
 
450 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  40.69 
 
 
406 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  39.52 
 
 
535 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>