More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1070 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  100 
 
 
393 aa  786    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  52.42 
 
 
385 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.97 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  42 
 
 
453 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  40.05 
 
 
409 aa  245  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.4 
 
 
389 aa  239  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.23 
 
 
375 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.18 
 
 
451 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.77 
 
 
389 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  46.37 
 
 
449 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  45.43 
 
 
450 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.29 
 
 
401 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  42.13 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  42.14 
 
 
395 aa  225  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  43.15 
 
 
456 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  43.42 
 
 
495 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  41 
 
 
462 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  42.34 
 
 
463 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  42.34 
 
 
457 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  42.34 
 
 
457 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.71 
 
 
478 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 
493 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  43.75 
 
 
493 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  43.75 
 
 
493 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  42.15 
 
 
412 aa  222  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  43.93 
 
 
494 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  38.69 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  43.93 
 
 
494 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  43.09 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  43.09 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  43.09 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  43.42 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  43.09 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  43.09 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  37.76 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  43.09 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.71 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  43.09 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.5 
 
 
487 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.94 
 
 
381 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  43.53 
 
 
449 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  43.53 
 
 
450 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  43.61 
 
 
494 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  44.16 
 
 
450 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  44.16 
 
 
450 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.16 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.24 
 
 
509 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  44.16 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.92 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  44.65 
 
 
453 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  43.22 
 
 
450 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  43.85 
 
 
450 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  43.85 
 
 
450 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.99 
 
 
400 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  43.85 
 
 
450 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.81 
 
 
451 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.83 
 
 
500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.49 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.34 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  39.44 
 
 
502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  42.86 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  42.37 
 
 
456 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.85 
 
 
486 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  42.81 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  41.33 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  39.52 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  40.82 
 
 
451 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  45.13 
 
 
505 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.02 
 
 
511 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  39.88 
 
 
455 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  45.49 
 
 
419 aa  216  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  43.04 
 
 
455 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  43.04 
 
 
455 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  44.55 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  43.53 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.19 
 
 
446 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.02 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  44.77 
 
 
507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.38 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  43.04 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  40.31 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  39.61 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  39.34 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  39.34 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  37.74 
 
 
413 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  40.12 
 
 
459 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.89 
 
 
502 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.89 
 
 
502 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.89 
 
 
502 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.69 
 
 
465 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.89 
 
 
502 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.89 
 
 
485 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.89 
 
 
502 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  40.36 
 
 
498 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>