More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2200 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2494  serine protease  89.11 
 
 
459 aa  736    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  100 
 
 
442 aa  862    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  42.78 
 
 
409 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.72 
 
 
453 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  40.97 
 
 
389 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 
509 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.44 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  37.76 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.18 
 
 
521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  39.48 
 
 
389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.68 
 
 
459 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 
476 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.16 
 
 
466 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  42.5 
 
 
459 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.19 
 
 
385 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.71 
 
 
500 aa  209  9e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 
386 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.36 
 
 
461 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  42.9 
 
 
452 aa  206  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.59 
 
 
411 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.8 
 
 
457 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  35.92 
 
 
412 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.94 
 
 
453 aa  204  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.38 
 
 
471 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.18 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.78 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41.8 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.36 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  40.5 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  36.43 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.19 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.4 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.97 
 
 
475 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.49 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.9 
 
 
476 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 
428 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  34.66 
 
 
406 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.55 
 
 
462 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.94 
 
 
476 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.62 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  37.89 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  38.92 
 
 
368 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.78 
 
 
392 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.5 
 
 
435 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37.24 
 
 
395 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.53 
 
 
513 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.91 
 
 
408 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.48 
 
 
476 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 
401 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  40.26 
 
 
308 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  35.99 
 
 
485 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  40.97 
 
 
419 aa  192  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.83 
 
 
405 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  34.27 
 
 
389 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.66 
 
 
408 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  40.38 
 
 
387 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.5 
 
 
497 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
497 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  43.06 
 
 
528 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.06 
 
 
501 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  39.14 
 
 
318 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.06 
 
 
501 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.3 
 
 
415 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  37.92 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 
496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.26 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.98 
 
 
404 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.75 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.98 
 
 
410 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  39.06 
 
 
412 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.94 
 
 
386 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  37.97 
 
 
396 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  40.48 
 
 
374 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  36.99 
 
 
413 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.22 
 
 
492 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  41.69 
 
 
383 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.3 
 
 
483 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  36.99 
 
 
413 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.3 
 
 
483 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  43.42 
 
 
511 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  41.69 
 
 
397 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  36.08 
 
 
385 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  34.78 
 
 
506 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.05 
 
 
477 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  39.69 
 
 
411 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 
387 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.05 
 
 
477 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  39.46 
 
 
411 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  34.7 
 
 
487 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.79 
 
 
415 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  35.45 
 
 
493 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  33.76 
 
 
404 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  36.75 
 
 
413 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  42.2 
 
 
479 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  36.64 
 
 
413 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.67 
 
 
428 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  36.64 
 
 
413 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.26 
 
 
375 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  36.64 
 
 
413 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>