More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3537 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  100 
 
 
387 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  82.78 
 
 
389 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  42.09 
 
 
413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  43.27 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  42.4 
 
 
412 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  45.74 
 
 
393 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.18 
 
 
500 aa  225  9e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.85 
 
 
381 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  47.99 
 
 
466 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  36.7 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.32 
 
 
389 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  42.56 
 
 
411 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.25 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  47.2 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.02 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.5 
 
 
478 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.16 
 
 
476 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  42.62 
 
 
385 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  42.54 
 
 
389 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.07 
 
 
511 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  41.54 
 
 
395 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  38.89 
 
 
415 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.58 
 
 
464 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.77 
 
 
535 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.99 
 
 
428 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44.14 
 
 
461 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.46 
 
 
457 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  40.71 
 
 
308 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  40.57 
 
 
453 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  41.92 
 
 
453 aa  206  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  42.75 
 
 
369 aa  205  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.79 
 
 
464 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  38.39 
 
 
396 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.81 
 
 
476 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 
384 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  36.92 
 
 
396 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.4 
 
 
497 aa  204  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.64 
 
 
469 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  36.47 
 
 
406 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.52 
 
 
386 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  44.16 
 
 
348 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.38 
 
 
458 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.96 
 
 
476 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  35.87 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  40.36 
 
 
424 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.84 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.95 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.07 
 
 
513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  47.62 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45.38 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.02 
 
 
502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.86 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.15 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  39.58 
 
 
402 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  44.41 
 
 
362 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.77 
 
 
450 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  45.66 
 
 
323 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  39.05 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.14 
 
 
452 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.37 
 
 
476 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.55 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  41.05 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  35.83 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.07 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  34.42 
 
 
467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.49 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  35.83 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.49 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  38.53 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  39.04 
 
 
506 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.17 
 
 
504 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.22 
 
 
477 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  39.36 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.96 
 
 
451 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  38.64 
 
 
451 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.64 
 
 
450 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.64 
 
 
450 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.64 
 
 
450 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  37.13 
 
 
442 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.26 
 
 
375 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.64 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  42.05 
 
 
508 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.13 
 
 
462 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  38.81 
 
 
453 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.91 
 
 
456 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  41.67 
 
 
473 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  35.55 
 
 
409 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40 
 
 
509 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.32 
 
 
505 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  38.24 
 
 
407 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.71 
 
 
449 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  38.07 
 
 
450 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  42.35 
 
 
473 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.06 
 
 
455 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  40.55 
 
 
508 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  37.46 
 
 
450 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>