More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1292 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  100 
 
 
412 aa  823    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  73.37 
 
 
424 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  73.37 
 
 
424 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.31 
 
 
401 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  39.23 
 
 
406 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  40.82 
 
 
404 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  40.93 
 
 
391 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  41.18 
 
 
391 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  40.69 
 
 
391 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  40.93 
 
 
391 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  41.18 
 
 
391 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  40.69 
 
 
391 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  41.56 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  40.2 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  40.2 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  40.29 
 
 
395 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  45.51 
 
 
379 aa  250  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  50.35 
 
 
419 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
435 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  42.86 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  39.36 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  37.44 
 
 
413 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  37.44 
 
 
413 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  36.62 
 
 
413 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  39.6 
 
 
393 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  36.62 
 
 
413 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  42.69 
 
 
413 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  36.62 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 
400 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  36.62 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  37.2 
 
 
413 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  37.2 
 
 
413 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  42.39 
 
 
413 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.53 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  39.47 
 
 
409 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  38.48 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  38.96 
 
 
409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  42.5 
 
 
393 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  39.94 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  37.44 
 
 
385 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  38.97 
 
 
425 aa  218  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.03 
 
 
456 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  37.14 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  33 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.31 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  37.03 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.93 
 
 
513 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.06 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  32.15 
 
 
511 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  36.27 
 
 
463 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  42.76 
 
 
496 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  36.27 
 
 
457 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  36.27 
 
 
457 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.91 
 
 
504 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.89 
 
 
392 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  39.01 
 
 
472 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 
506 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  39.01 
 
 
472 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  36.9 
 
 
456 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  37.61 
 
 
450 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  41.41 
 
 
474 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  41.41 
 
 
474 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1081  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.68 
 
 
774 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.394549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1103  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.68 
 
 
774 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00762901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  41.41 
 
 
474 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  38.24 
 
 
456 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.48 
 
 
450 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  38.3 
 
 
451 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  38.74 
 
 
472 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  38.07 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.48 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.48 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.39 
 
 
408 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  37.22 
 
 
450 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.99 
 
 
408 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.18 
 
 
475 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.86 
 
 
502 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  36.2 
 
 
505 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  38.63 
 
 
498 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  36.97 
 
 
442 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.19 
 
 
450 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.05 
 
 
511 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.61 
 
 
450 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.61 
 
 
450 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.61 
 
 
450 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  41.2 
 
 
478 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  41.2 
 
 
478 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  39.69 
 
 
459 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  37.28 
 
 
412 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  36.72 
 
 
456 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  41.2 
 
 
475 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  41.2 
 
 
475 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  38.62 
 
 
453 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  41.2 
 
 
475 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  39.46 
 
 
476 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>