More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3992 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  78.56 
 
 
497 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  72.8 
 
 
528 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
501 aa  989    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  95.57 
 
 
497 aa  939    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
501 aa  989    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  77.11 
 
 
496 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.43 
 
 
475 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.43 
 
 
475 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.43 
 
 
475 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.35 
 
 
544 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.93 
 
 
497 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.48 
 
 
512 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.14 
 
 
517 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.01 
 
 
507 aa  312  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.05 
 
 
523 aa  243  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  42.81 
 
 
443 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.65 
 
 
569 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.99 
 
 
640 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.95 
 
 
512 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  38.65 
 
 
583 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  45.87 
 
 
575 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.97 
 
 
674 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.63 
 
 
420 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.92 
 
 
579 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  41.2 
 
 
594 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  44.08 
 
 
584 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  42.57 
 
 
423 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  44.56 
 
 
464 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.8 
 
 
471 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 
417 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  42.45 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  43.26 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.1 
 
 
545 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44 
 
 
366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.92 
 
 
349 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.4 
 
 
440 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 
440 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 
440 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.86 
 
 
524 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.03 
 
 
614 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.66 
 
 
460 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
424 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
515 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  38.81 
 
 
442 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  38.34 
 
 
395 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.35 
 
 
476 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.12 
 
 
475 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.58 
 
 
515 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.3 
 
 
515 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.88 
 
 
500 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  32.14 
 
 
467 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.52 
 
 
476 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.36 
 
 
384 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  37.76 
 
 
476 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.78 
 
 
469 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 
487 aa  186  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.2 
 
 
500 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  38.77 
 
 
673 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.41 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.67 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.9 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.68 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.61 
 
 
552 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  40.26 
 
 
459 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.44 
 
 
618 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  43.06 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  41.61 
 
 
459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.79 
 
 
471 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  37.12 
 
 
597 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.14 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.95 
 
 
476 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  39.65 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  35.77 
 
 
453 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.86 
 
 
483 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  37.76 
 
 
353 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.75 
 
 
558 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  38.67 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  38.67 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.86 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  37.96 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  39.57 
 
 
455 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  41.3 
 
 
351 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  38.74 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.74 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.45 
 
 
380 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.35 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  38.14 
 
 
381 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  38.74 
 
 
402 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  38.33 
 
 
413 aa  180  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  38.33 
 
 
413 aa  180  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  38.33 
 
 
413 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  38.14 
 
 
381 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  38.05 
 
 
366 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  38.33 
 
 
413 aa  180  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  38.74 
 
 
402 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  38.7 
 
 
419 aa  179  8e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  35.38 
 
 
527 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  38.74 
 
 
402 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>