More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2513 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
392 aa  786    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.03 
 
 
367 aa  335  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.06 
 
 
389 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  38.38 
 
 
385 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 
415 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.81 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  43.1 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  42.47 
 
 
413 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 
506 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  36.12 
 
 
406 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  38.51 
 
 
459 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.27 
 
 
453 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  38.58 
 
 
459 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  45.36 
 
 
453 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
384 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.81 
 
 
498 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.96 
 
 
453 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  35.75 
 
 
404 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  37.83 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  38.71 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.03 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  42.39 
 
 
393 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  41.79 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  39.3 
 
 
391 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  39.3 
 
 
391 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  39.3 
 
 
391 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  38.82 
 
 
409 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  41.47 
 
 
395 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  43.01 
 
 
500 aa  199  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  39 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  39 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  39 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  39 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.32 
 
 
505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.52 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.19 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.43 
 
 
513 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  41.02 
 
 
419 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  36.46 
 
 
391 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  36.98 
 
 
391 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  43.75 
 
 
385 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  34.34 
 
 
389 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  40.26 
 
 
459 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.54 
 
 
511 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  41.58 
 
 
400 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.33 
 
 
381 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  37.78 
 
 
412 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.36 
 
 
511 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.01 
 
 
475 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  40.26 
 
 
442 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.37 
 
 
464 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  42.51 
 
 
411 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.6 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  37.17 
 
 
409 aa  189  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  41.4 
 
 
473 aa  189  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  38.11 
 
 
396 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.93 
 
 
504 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  40.34 
 
 
308 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.31 
 
 
400 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.35 
 
 
466 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 
521 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  41.13 
 
 
401 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 
472 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.01 
 
 
464 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  37.58 
 
 
379 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.07 
 
 
462 aa  185  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.43 
 
 
457 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  35.47 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  38.67 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.75 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.21 
 
 
415 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  40.42 
 
 
424 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  37.39 
 
 
372 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  38.67 
 
 
413 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  38.67 
 
 
413 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  36.23 
 
 
361 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  37.1 
 
 
462 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  40.42 
 
 
424 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.95 
 
 
535 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  38.37 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  38.37 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  38.37 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.45 
 
 
415 aa  183  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  36.08 
 
 
407 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  38.07 
 
 
413 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.21 
 
 
387 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.25 
 
 
435 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  38.07 
 
 
413 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  35.26 
 
 
377 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.58 
 
 
502 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.26 
 
 
410 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.43 
 
 
488 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.73 
 
 
480 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.86 
 
 
492 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  38.07 
 
 
413 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.64 
 
 
485 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  38.07 
 
 
413 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  37.66 
 
 
318 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  36.52 
 
 
391 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>