More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0175 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 347 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.5 
 
 		 351 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  47.34 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  50.16 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.42 
 
 		 316 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  49.07 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  43.03 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  46.24 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  46.09 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  44.71 
 
 		 348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.35 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  47.42 
 
 		 345 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.7 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  42.53 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.37 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.9 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.3 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.23 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.72 
 
 		 318 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  46.91 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.83 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.38 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  45.83 
 
 		 379 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.96 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  39.02 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  44.24 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.51 
 
 		 476 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.17 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.4 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.41 
 
 		 478 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  43.97 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.8 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.59 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.52 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  43.86 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.62 
 
 		 465 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  43.51 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.54 
 
 		 504 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  44.96 
 
 		 474 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.96 
 
 		 474 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  42.47 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  43.16 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  42.47 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  42.96 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  43.42 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  41.58 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.16 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.19 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.81 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.33 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 		 387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  39.21 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  43.42 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  43.42 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  43.42 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.57 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.11 
 
 		 464 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 		 317 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.15 
 
 		 511 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.85 
 
 		 487 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.56 
 
 		 471 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.83 
 
 		 476 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  43.12 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  43.75 
 
 		 525 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.18 
 
 		 472 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  43.06 
 
 		 402 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  36.34 
 
 		 498 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.23 
 
 		 476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  42.55 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.2 
 
 		 474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.78 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.55 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  39.13 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.61 
 
 		 502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.9 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  40.48 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  40.59 
 
 		 382 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.93 
 
 		 500 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  44.66 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.43 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.21 
 
 		 502 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.25 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.66 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43 
 
 		 403 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.66 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.72 
 
 		 475 aa  195  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.7 
 
 		 404 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.61 
 
 		 386 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  41.33 
 
 		 494 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.33 
 
 		 493 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  41.33 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.44 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.33 
 
 		 493 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>