More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2676 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  100 
 
 
351 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  48.78 
 
 
323 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  46.69 
 
 
348 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  44.27 
 
 
308 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  44.75 
 
 
318 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  46.81 
 
 
341 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  43.03 
 
 
347 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  42.94 
 
 
345 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.37 
 
 
316 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.68 
 
 
339 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.09 
 
 
351 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  46.81 
 
 
347 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
318 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  46.2 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.77 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 
318 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.3 
 
 
464 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
388 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.57 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.88 
 
 
471 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.25 
 
 
476 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.94 
 
 
479 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.54 
 
 
480 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.54 
 
 
472 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  40.48 
 
 
424 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.12 
 
 
461 aa  215  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.73 
 
 
513 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.36 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  39.94 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.89 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.23 
 
 
476 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.06 
 
 
476 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  39.13 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  39.13 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.98 
 
 
411 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.14 
 
 
457 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  38.82 
 
 
382 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.79 
 
 
500 aa  212  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.1 
 
 
385 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.05 
 
 
428 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.58 
 
 
474 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.6 
 
 
415 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  39.01 
 
 
415 aa  208  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  38.39 
 
 
459 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.69 
 
 
474 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40 
 
 
483 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.39 
 
 
476 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40 
 
 
449 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.65 
 
 
467 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  39.64 
 
 
402 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  39.64 
 
 
402 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.32 
 
 
384 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
381 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.57 
 
 
464 aa  205  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41.25 
 
 
474 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.8 
 
 
462 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  38.55 
 
 
418 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.66 
 
 
471 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.04 
 
 
474 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 
387 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.18 
 
 
334 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  36.9 
 
 
420 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.15 
 
 
405 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.36 
 
 
481 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.31 
 
 
494 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.31 
 
 
494 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.3 
 
 
505 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.58 
 
 
493 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42.18 
 
 
482 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.23 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.7 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.88 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  39.88 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  39.88 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.14 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.26 
 
 
477 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.26 
 
 
477 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  38.15 
 
 
464 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 
406 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  40.73 
 
 
514 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.12 
 
 
452 aa  198  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.25 
 
 
389 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.69 
 
 
453 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  37.6 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.52 
 
 
483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  38.55 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.52 
 
 
483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.07 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  38.95 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  37.96 
 
 
493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  43.48 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.64 
 
 
476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  37.96 
 
 
493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  38.78 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  37.96 
 
 
493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.87 
 
 
479 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  38.21 
 
 
397 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  42.12 
 
 
516 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>