More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3861 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 317 aa  594  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.21 
 
 		 326 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.87 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  64.6 
 
 		 343 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  66.23 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.9 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  59.93 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  45.7 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.85 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  39.94 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.3 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  37.46 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.33 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  37.17 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  41.88 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  40.51 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  38.1 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.78 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  39.03 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  43.98 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.28 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.47 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 351 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  39.94 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.45 
 
 		 471 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.33 
 
 		 452 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  34.3 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  40.57 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  40.89 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.14 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  35.16 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.33 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.6 
 
 		 513 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  40.41 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  37.85 
 
 		 498 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.4 
 
 		 415 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.19 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  38.08 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.13 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  41.3 
 
 		 386 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  39.03 
 
 		 402 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  39.03 
 
 		 402 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.76 
 
 		 466 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.41 
 
 		 464 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.28 
 
 		 443 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  40.55 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.24 
 
 		 471 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.13 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.49 
 
 		 476 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  35.58 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.13 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.46 
 
 		 475 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  37.95 
 
 		 397 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.43 
 
 		 416 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 472 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  39.66 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.52 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.13 
 
 		 483 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  36.13 
 
 		 459 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.13 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.38 
 
 		 496 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.95 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  38.49 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.79 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.29 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  38.46 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  39.66 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.81 
 
 		 497 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  36.39 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  34.07 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  34.4 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  35.96 
 
 		 472 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  37.64 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  38.28 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  39.46 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  36.73 
 
 		 483 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.24 
 
 		 512 aa  165  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.04 
 
 		 459 aa  165  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.04 
 
 		 459 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.92 
 
 		 389 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  42.04 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.25 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.24 
 
 		 404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  37.87 
 
 		 485 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.26 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  32.47 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  39.14 
 
 		 517 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  43.59 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.24 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  35.77 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  34.56 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.87 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  36.33 
 
 		 468 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  39.02 
 
 		 411 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.97 
 
 		 474 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.93 
 
 		 497 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  41.97 
 
 		 474 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>