More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0476 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 316 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  57.57 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  58.18 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.03 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.97 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.29 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.76 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.1 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  49.37 
 
 		 347 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  48.73 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  48.42 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  48.88 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  45.37 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  43.69 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.69 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  49.19 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  42.44 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.85 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.42 
 
 		 475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.28 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.08 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.17 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.34 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.29 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.41 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.36 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.7 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.93 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.62 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.75 
 
 		 476 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.45 
 
 		 480 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  38.08 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  40.39 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.5 
 
 		 453 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.07 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.27 
 
 		 513 aa  191  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.99 
 
 		 478 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.73 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  36.9 
 
 		 464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.34 
 
 		 485 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.88 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.92 
 
 		 476 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.99 
 
 		 482 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.71 
 
 		 481 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  42.31 
 
 		 420 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.11 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.26 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.15 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.89 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  42.42 
 
 		 388 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.82 
 
 		 484 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.92 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.65 
 
 		 474 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.06 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  43.21 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.87 
 
 		 487 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.06 
 
 		 504 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.84 
 
 		 464 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.16 
 
 		 388 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  43.17 
 
 		 520 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  41.76 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.31 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  42.35 
 
 		 473 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.87 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.96 
 
 		 477 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.54 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.15 
 
 		 476 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.96 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  42.7 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.96 
 
 		 482 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  43.33 
 
 		 499 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.79 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.33 
 
 		 453 aa  185  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  42.38 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.2 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  42.8 
 
 		 444 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  34.33 
 
 		 476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.12 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.59 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.38 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.57 
 
 		 481 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  43.88 
 
 		 502 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.55 
 
 		 473 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  39.93 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.33 
 
 		 472 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.55 
 
 		 473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  37.34 
 
 		 473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  39.78 
 
 		 456 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.91 
 
 		 474 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  42.59 
 
 		 496 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.7 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.14 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.11 
 
 		 492 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.55 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>