More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0424 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  100 
 
 
444 aa  900    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  58.41 
 
 
483 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.01 
 
 
450 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  53.19 
 
 
525 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  48.33 
 
 
480 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.9 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.32 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.58 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  38.9 
 
 
465 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  39.71 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.19 
 
 
476 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.15 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.75 
 
 
478 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.63 
 
 
476 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.83 
 
 
476 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.58 
 
 
452 aa  263  6e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  40.4 
 
 
476 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.18 
 
 
473 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.56 
 
 
464 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  40.19 
 
 
474 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.19 
 
 
474 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 
472 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  36.64 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.27 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  36.64 
 
 
458 aa  253  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.04 
 
 
471 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.07 
 
 
457 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  37.64 
 
 
495 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.71 
 
 
474 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  35.79 
 
 
485 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  47.84 
 
 
464 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  36.7 
 
 
461 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.21 
 
 
453 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.91 
 
 
384 aa  249  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  37.18 
 
 
495 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  37.18 
 
 
495 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  37.18 
 
 
495 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  37.18 
 
 
483 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  37.18 
 
 
495 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  37.18 
 
 
483 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  37.18 
 
 
483 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  35.27 
 
 
483 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.52 
 
 
455 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.27 
 
 
483 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  39.01 
 
 
457 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  34.64 
 
 
453 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.4 
 
 
460 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.78 
 
 
449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.47 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.76 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  38.39 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  42.43 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  38.16 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  37.32 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  36.72 
 
 
494 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  36.63 
 
 
453 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  36.95 
 
 
493 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  36.95 
 
 
493 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  45.06 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  36.72 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  37.41 
 
 
494 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  36.32 
 
 
493 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  35.67 
 
 
473 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  37.5 
 
 
485 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.35 
 
 
455 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.41 
 
 
482 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37 
 
 
462 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  34.66 
 
 
483 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.86 
 
 
476 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  45.05 
 
 
385 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  36.49 
 
 
494 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.57 
 
 
428 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.64 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  39.55 
 
 
474 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.39 
 
 
456 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  40.44 
 
 
477 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  39.27 
 
 
474 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  36.02 
 
 
449 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  38.84 
 
 
461 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  34.48 
 
 
469 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  37.95 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  41.64 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  41.64 
 
 
397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.2 
 
 
480 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.94 
 
 
451 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  38.62 
 
 
461 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  42.55 
 
 
394 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  42.14 
 
 
411 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.36 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.32 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  37.94 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  32.97 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.19 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  37.19 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>