More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2505 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  95.6 
 
 
319 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  65.81 
 
 
318 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  64.86 
 
 
318 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  54.57 
 
 
345 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.29 
 
 
316 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.44 
 
 
339 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  54.45 
 
 
348 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.24 
 
 
364 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  48.71 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  46.56 
 
 
323 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  46.08 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  44.79 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  42.77 
 
 
351 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  43.32 
 
 
308 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  42.02 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.23 
 
 
351 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  41.3 
 
 
347 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  42.14 
 
 
420 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.26 
 
 
461 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  42.91 
 
 
388 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  38.64 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.29 
 
 
476 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.23 
 
 
462 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  41.7 
 
 
415 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.31 
 
 
384 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.64 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.51 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40 
 
 
476 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  43.25 
 
 
498 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.27 
 
 
381 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.8 
 
 
476 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
402 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  42.12 
 
 
402 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  41.07 
 
 
397 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.81 
 
 
457 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.25 
 
 
476 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.53 
 
 
343 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  38.3 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.64 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.62 
 
 
500 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  42.5 
 
 
411 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.48 
 
 
474 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.61 
 
 
415 aa  178  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.07 
 
 
424 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.76 
 
 
386 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.14 
 
 
317 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  37.65 
 
 
382 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  37.61 
 
 
402 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.57 
 
 
464 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.59 
 
 
475 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.05 
 
 
386 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.22 
 
 
428 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  38.89 
 
 
528 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.67 
 
 
480 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.7 
 
 
389 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40 
 
 
472 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.74 
 
 
312 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  41.57 
 
 
408 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.54 
 
 
311 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.18 
 
 
387 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.15 
 
 
487 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  41.57 
 
 
408 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40 
 
 
459 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  39.46 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.57 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  35.46 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.94 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40 
 
 
459 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  36.18 
 
 
375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  37.37 
 
 
453 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.67 
 
 
367 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.87 
 
 
405 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.22 
 
 
466 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  37.55 
 
 
523 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  43.53 
 
 
488 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.61 
 
 
401 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  38.97 
 
 
523 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  37.63 
 
 
481 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.36 
 
 
475 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.34 
 
 
410 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.99 
 
 
473 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.94 
 
 
464 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 
479 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  40.53 
 
 
401 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 
334 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  42.14 
 
 
505 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 
511 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.62 
 
 
502 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.34 
 
 
528 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.62 
 
 
502 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.62 
 
 
502 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.62 
 
 
461 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.4 
 
 
416 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.62 
 
 
485 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  39.71 
 
 
537 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.63 
 
 
385 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.62 
 
 
502 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.62 
 
 
502 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.97 
 
 
474 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>