More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2227 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
312 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.21 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  61.09 
 
 
343 aa  311  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.9 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  57.81 
 
 
304 aa  288  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.07 
 
 
326 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.79 
 
 
327 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  45.19 
 
 
348 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.41 
 
 
316 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  37.11 
 
 
318 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 
339 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  41.21 
 
 
341 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  40.82 
 
 
347 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  42.29 
 
 
464 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  41.07 
 
 
423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  35.92 
 
 
308 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  39.68 
 
 
347 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  40.51 
 
 
347 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.54 
 
 
478 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 
384 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.43 
 
 
452 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.36 
 
 
466 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.15 
 
 
475 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.14 
 
 
476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  42.67 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  41.1 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.43 
 
 
471 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.46 
 
 
453 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  40.98 
 
 
485 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.44 
 
 
473 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.09 
 
 
457 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.2 
 
 
318 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.59 
 
 
311 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 
472 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.13 
 
 
476 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.9 
 
 
324 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  37.08 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.26 
 
 
483 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.92 
 
 
381 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.72 
 
 
476 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.46 
 
 
415 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.53 
 
 
318 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.35 
 
 
483 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.35 
 
 
483 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.84 
 
 
485 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.93 
 
 
385 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.49 
 
 
500 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  39.58 
 
 
498 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.66 
 
 
383 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  39.22 
 
 
464 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  38.61 
 
 
451 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.74 
 
 
318 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.03 
 
 
424 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.13 
 
 
474 aa  175  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.94 
 
 
511 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  39.68 
 
 
597 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.29 
 
 
511 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.78 
 
 
398 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.91 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.35 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.39 
 
 
513 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39.78 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.57 
 
 
502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  38.36 
 
 
506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 
398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.78 
 
 
404 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.51 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.09 
 
 
458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.84 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.91 
 
 
464 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  37.04 
 
 
498 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 
428 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.88 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.95 
 
 
364 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.24 
 
 
476 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.71 
 
 
461 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  38.87 
 
 
491 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  38.78 
 
 
450 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  40.34 
 
 
471 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  37.18 
 
 
409 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  38.81 
 
 
446 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  36.82 
 
 
402 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  40.14 
 
 
395 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.25 
 
 
545 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.68 
 
 
392 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.5 
 
 
367 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  39.12 
 
 
450 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.11 
 
 
450 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.11 
 
 
450 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.11 
 
 
450 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.36 
 
 
450 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.41 
 
 
482 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  37.17 
 
 
449 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  36.65 
 
 
505 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  40.43 
 
 
535 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  35.97 
 
 
453 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  39.92 
 
 
462 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  38.62 
 
 
383 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>