More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2210 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
319 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  95.6 
 
 
318 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  66.13 
 
 
318 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  65.5 
 
 
318 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  54.75 
 
 
345 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.03 
 
 
316 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.13 
 
 
339 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  54.79 
 
 
348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.68 
 
 
364 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  49.35 
 
 
341 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  45.91 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  46.75 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  46.79 
 
 
347 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  43.77 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  42.35 
 
 
318 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  42.95 
 
 
308 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.83 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  43.37 
 
 
347 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.55 
 
 
304 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  42.14 
 
 
420 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  36.7 
 
 
391 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  42.52 
 
 
388 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.75 
 
 
461 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 
303 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.06 
 
 
384 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  40.71 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.47 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  43.01 
 
 
411 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
408 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.67 
 
 
389 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.24 
 
 
476 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  39.84 
 
 
462 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  44.35 
 
 
408 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.85 
 
 
476 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.08 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.07 
 
 
415 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.53 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.54 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
397 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.44 
 
 
428 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.03 
 
 
476 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.85 
 
 
476 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 
415 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.12 
 
 
424 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  41.7 
 
 
406 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  36.9 
 
 
382 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  36.64 
 
 
382 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.57 
 
 
453 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.36 
 
 
487 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  36.81 
 
 
402 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  40.51 
 
 
402 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.83 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  40.51 
 
 
402 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  39.08 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.54 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.07 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.86 
 
 
500 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.94 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.07 
 
 
459 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  41.46 
 
 
502 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  41.46 
 
 
485 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  39.61 
 
 
472 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  41.46 
 
 
502 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  41.46 
 
 
502 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  41.46 
 
 
502 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  41.46 
 
 
502 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.46 
 
 
461 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.92 
 
 
452 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.24 
 
 
474 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.55 
 
 
453 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
386 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 
511 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  42.68 
 
 
372 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.84 
 
 
416 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.4 
 
 
457 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  42.21 
 
 
418 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.73 
 
 
480 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  38.37 
 
 
528 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 
401 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  37.3 
 
 
375 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 
423 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  40 
 
 
395 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  43.1 
 
 
488 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.61 
 
 
464 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 
334 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.18 
 
 
478 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.15 
 
 
475 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  40.31 
 
 
525 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  40.26 
 
 
464 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.32 
 
 
458 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.79 
 
 
505 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.78 
 
 
481 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  40.07 
 
 
473 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.77 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  40.59 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  41.6 
 
 
479 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.11 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  43.29 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  42.04 
 
 
545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>