More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0866 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
343 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  81.48 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  64.6 
 
 
317 aa  345  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.56 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.73 
 
 
326 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  61.09 
 
 
312 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  61.22 
 
 
304 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  44.62 
 
 
348 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.85 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.26 
 
 
339 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  45.27 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  43.59 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  42.17 
 
 
347 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  45.51 
 
 
345 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  42.21 
 
 
347 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.03 
 
 
351 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  37.54 
 
 
308 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.26 
 
 
318 aa  196  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  38.51 
 
 
351 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
318 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  38.87 
 
 
318 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  42.02 
 
 
323 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.54 
 
 
324 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.73 
 
 
364 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.44 
 
 
485 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.53 
 
 
318 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.53 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  32.34 
 
 
452 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  43.43 
 
 
423 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.85 
 
 
500 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  40.27 
 
 
395 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.93 
 
 
464 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.36 
 
 
483 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.36 
 
 
483 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.37 
 
 
502 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  42.09 
 
 
458 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  36.16 
 
 
409 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.14 
 
 
381 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.19 
 
 
476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.2 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.78 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.78 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.07 
 
 
511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  39.01 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.45 
 
 
476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  39.01 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 
640 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.24 
 
 
472 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.84 
 
 
476 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  37.42 
 
 
420 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
464 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.88 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 
311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.98 
 
 
509 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.38 
 
 
443 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.97 
 
 
515 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.36 
 
 
473 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  43.14 
 
 
385 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  34.42 
 
 
472 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.88 
 
 
408 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  36.1 
 
 
453 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.13 
 
 
459 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  37.42 
 
 
584 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.82 
 
 
384 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.13 
 
 
459 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  36.12 
 
 
374 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  34.81 
 
 
392 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.2 
 
 
387 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  33 
 
 
383 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.73 
 
 
483 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  39.67 
 
 
597 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  40.21 
 
 
351 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.28 
 
 
471 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.01 
 
 
474 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.71 
 
 
392 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.27 
 
 
614 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.46 
 
 
464 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  33.62 
 
 
375 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.54 
 
 
410 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.04 
 
 
466 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  36.33 
 
 
368 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  32.07 
 
 
472 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.85 
 
 
416 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.49 
 
 
386 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.69 
 
 
467 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  35.96 
 
 
415 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  33.33 
 
 
402 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  33.33 
 
 
388 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.13 
 
 
506 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  38.24 
 
 
520 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  37.63 
 
 
503 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  38.39 
 
 
575 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.81 
 
 
420 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.07 
 
 
457 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  35.11 
 
 
464 aa  155  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  41.3 
 
 
413 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  37.24 
 
 
457 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  38.74 
 
 
418 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  33.33 
 
 
402 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  33.33 
 
 
402 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>