More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0630 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  100 
 
 
347 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  95.1 
 
 
347 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  79.83 
 
 
341 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  50.17 
 
 
348 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  49.7 
 
 
323 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  46.79 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  48.54 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.37 
 
 
316 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.38 
 
 
351 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  47.11 
 
 
351 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  46.09 
 
 
347 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  46.82 
 
 
308 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50 
 
 
339 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.37 
 
 
319 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.63 
 
 
318 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.19 
 
 
318 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.37 
 
 
318 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.37 
 
 
364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  47.19 
 
 
472 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.74 
 
 
464 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  45.86 
 
 
471 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.34 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  44.52 
 
 
476 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  46.15 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.94 
 
 
476 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.57 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.61 
 
 
466 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  46.27 
 
 
461 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 
343 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  45.68 
 
 
420 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.7 
 
 
464 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  43.88 
 
 
525 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.25 
 
 
476 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.64 
 
 
483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.64 
 
 
483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.87 
 
 
453 aa  212  7e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.49 
 
 
459 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.61 
 
 
386 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.1 
 
 
334 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  41.49 
 
 
459 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  42.91 
 
 
388 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.59 
 
 
457 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  42.07 
 
 
452 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.72 
 
 
389 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  43.21 
 
 
382 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  42.12 
 
 
369 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.05 
 
 
372 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  44.4 
 
 
402 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  46.33 
 
 
304 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  44.4 
 
 
402 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.3 
 
 
478 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.64 
 
 
387 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.59 
 
 
485 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.33 
 
 
458 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.74 
 
 
462 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 
410 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.15 
 
 
416 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
424 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.33 
 
 
381 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  37.86 
 
 
418 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.91 
 
 
415 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.9 
 
 
475 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.86 
 
 
483 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  41.81 
 
 
411 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.79 
 
 
415 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  37.05 
 
 
391 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.39 
 
 
453 aa  202  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.61 
 
 
513 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  41.54 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.32 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.09 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  40.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.05 
 
 
500 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  44.64 
 
 
411 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  44.13 
 
 
406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  41.18 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.25 
 
 
476 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  38.77 
 
 
459 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  39.32 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.21 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  44.21 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  41.64 
 
 
523 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  42.08 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 
379 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.24 
 
 
480 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.02 
 
 
487 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  38.8 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43.12 
 
 
403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  42.2 
 
 
469 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.38 
 
 
473 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.82 
 
 
312 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.07 
 
 
383 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.57 
 
 
405 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  39.34 
 
 
397 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.36 
 
 
405 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>