More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3668 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
304 aa  567  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.46 
 
 
334 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  61.22 
 
 
343 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.93 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.81 
 
 
312 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.92 
 
 
326 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.79 
 
 
327 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  45.25 
 
 
348 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  44.59 
 
 
347 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  46 
 
 
347 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  43.93 
 
 
341 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.93 
 
 
316 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  45 
 
 
347 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  36.57 
 
 
318 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.02 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  39.68 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  42.01 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.24 
 
 
319 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.15 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  37.33 
 
 
308 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
318 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.2 
 
 
487 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.8 
 
 
351 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.93 
 
 
464 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.67 
 
 
374 aa  188  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
318 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  42.28 
 
 
345 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.3 
 
 
483 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.3 
 
 
483 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.64 
 
 
502 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.94 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.52 
 
 
415 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.64 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.19 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  41.33 
 
 
409 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.6 
 
 
424 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.87 
 
 
476 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  39.24 
 
 
423 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.64 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.69 
 
 
462 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.08 
 
 
464 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.38 
 
 
442 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.44 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.15 
 
 
478 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.56 
 
 
513 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.69 
 
 
381 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.49 
 
 
483 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.54 
 
 
476 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.73 
 
 
502 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.52 
 
 
411 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.3 
 
 
364 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.39 
 
 
461 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  42.86 
 
 
485 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.88 
 
 
476 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  36 
 
 
588 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.52 
 
 
457 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  36 
 
 
578 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  37.27 
 
 
442 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.78 
 
 
464 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.91 
 
 
452 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.07 
 
 
428 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.07 
 
 
369 aa  175  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  39.19 
 
 
385 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  35.81 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.69 
 
 
506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.08 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.72 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.5 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.8 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  38.1 
 
 
396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.24 
 
 
408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.09 
 
 
459 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  38.24 
 
 
408 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  38.55 
 
 
491 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  40.07 
 
 
535 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.22 
 
 
415 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  37.08 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.58 
 
 
472 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.43 
 
 
396 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  37.59 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.91 
 
 
508 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  37.08 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.95 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.01 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.92 
 
 
476 aa  171  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.78 
 
 
469 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  37.08 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 
471 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  37.08 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  37.55 
 
 
401 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  37.17 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  37.08 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.61 
 
 
384 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.55 
 
 
401 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  37.08 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  38.43 
 
 
498 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.5 
 
 
471 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  38.87 
 
 
524 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  39.18 
 
 
402 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>