More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  100 
 
 
517 aa  1012    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.73 
 
 
512 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.14 
 
 
501 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.14 
 
 
501 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.34 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.66 
 
 
507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.39 
 
 
497 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.31 
 
 
544 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.81 
 
 
497 aa  300  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  41.54 
 
 
528 aa  296  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  44.96 
 
 
584 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 
523 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 
475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 
475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 
475 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.17 
 
 
349 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.87 
 
 
515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.98 
 
 
443 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.57 
 
 
558 aa  233  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.12 
 
 
439 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 
569 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.99 
 
 
674 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  48.89 
 
 
485 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.67 
 
 
539 aa  227  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  46.86 
 
 
417 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.53 
 
 
527 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.01 
 
 
512 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  44.23 
 
 
423 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  43.08 
 
 
597 aa  223  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.55 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 
518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.97 
 
 
545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 
579 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.87 
 
 
515 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.56 
 
 
614 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.33 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  43.96 
 
 
489 aa  220  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.87 
 
 
440 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.87 
 
 
440 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.87 
 
 
440 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.58 
 
 
515 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  43.16 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.62 
 
 
436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.02 
 
 
428 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 
420 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  43.55 
 
 
673 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.24 
 
 
379 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.86 
 
 
434 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  40.46 
 
 
594 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.18 
 
 
524 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.79 
 
 
537 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.22 
 
 
389 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  44.81 
 
 
575 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.64 
 
 
485 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  46.67 
 
 
379 aa  207  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.68 
 
 
486 aa  207  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.66 
 
 
487 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.74 
 
 
412 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  48.06 
 
 
460 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.89 
 
 
423 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  44.95 
 
 
383 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.02 
 
 
385 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.73 
 
 
552 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.95 
 
 
506 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.09 
 
 
916 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.73 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.43 
 
 
577 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  44.52 
 
 
513 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.98 
 
 
640 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.15 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.37 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.32 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  43.46 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  39.93 
 
 
471 aa  196  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.98 
 
 
398 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.29 
 
 
384 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.58 
 
 
387 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  39.26 
 
 
412 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  41.39 
 
 
407 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.05 
 
 
500 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  44.01 
 
 
402 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  44.17 
 
 
386 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.76 
 
 
398 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  41.32 
 
 
453 aa  194  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 
469 aa  193  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 
456 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.36 
 
 
522 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  41.82 
 
 
583 aa  193  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  39.35 
 
 
455 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.67 
 
 
413 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  39.35 
 
 
455 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  39.35 
 
 
451 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.57 
 
 
484 aa  193  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  40.35 
 
 
393 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  39.4 
 
 
463 aa  193  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  43.66 
 
 
401 aa  193  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.66 
 
 
401 aa  193  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  39.35 
 
 
455 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  39.4 
 
 
457 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>