More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  100 
 
 		 552 aa  1073    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  54.66 
 
 		 584 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  56.82 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  63.64 
 
 		 575 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.26 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  56 
 
 		 515 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.45 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  49.71 
 
 		 673 aa  296  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  36.74 
 
 		 594 aa  288  1e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.91 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.01 
 
 		 640 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.95 
 
 		 569 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.58 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.28 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.08 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.46 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.19 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.7 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  46.51 
 
 		 525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.59 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.05 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  44.78 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  45.12 
 
 		 524 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  44.78 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.46 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.94 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  46.23 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.69 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.94 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.21 
 
 		 476 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.25 
 
 		 349 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  45.71 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  47.73 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.23 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  41.32 
 
 		 489 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  42.71 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  41.18 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  41.18 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  41.18 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.35 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 		 674 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.34 
 
 		 483 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.34 
 
 		 483 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.72 
 
 		 440 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.66 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.72 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.72 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.61 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  43.15 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.75 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  40.46 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.04 
 
 		 515 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.24 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  42.33 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  40.91 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.81 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.76 
 
 		 471 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  44.17 
 
 		 583 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  42.12 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.13 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.89 
 
 		 497 aa  196  7e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.2 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  41.2 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  43.66 
 
 		 496 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  42.25 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.94 
 
 		 588 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  43 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  39.4 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.66 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  39.53 
 
 		 472 aa  192  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  41.39 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  41.39 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  41.39 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  41.39 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  41.39 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  43.86 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  41.02 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.02 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.86 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  41.02 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.57 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.87 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.36 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  42.61 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  41.61 
 
 		 456 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.98 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  40.82 
 
 		 460 aa  192  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.33 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.78 
 
 		 556 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.4 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>