More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1212 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
471 aa  912    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  47.37 
 
 
583 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  49.35 
 
 
443 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.52 
 
 
487 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.87 
 
 
558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.59 
 
 
640 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  45.68 
 
 
527 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.45 
 
 
440 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.38 
 
 
537 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.92 
 
 
674 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.48 
 
 
349 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.39 
 
 
579 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.01 
 
 
485 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  42.97 
 
 
464 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.54 
 
 
512 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.41 
 
 
436 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  42.68 
 
 
489 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.48 
 
 
417 aa  229  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.73 
 
 
569 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  39.22 
 
 
584 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  44.16 
 
 
423 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.59 
 
 
515 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
518 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  41.54 
 
 
597 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.93 
 
 
544 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.24 
 
 
496 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.1 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.19 
 
 
614 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.38 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.15 
 
 
497 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.92 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.92 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.92 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.44 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  44.12 
 
 
575 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.83 
 
 
456 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.51 
 
 
524 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
515 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.77 
 
 
506 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.99 
 
 
515 aa  207  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 
523 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.37 
 
 
916 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  43.67 
 
 
395 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.92 
 
 
511 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  42.96 
 
 
485 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  40.14 
 
 
528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.24 
 
 
475 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.24 
 
 
475 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.24 
 
 
475 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.54 
 
 
439 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.79 
 
 
452 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  41.59 
 
 
673 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.26 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.66 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  42.53 
 
 
517 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.08 
 
 
428 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.97 
 
 
512 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 
507 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  40.11 
 
 
469 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40 
 
 
474 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.86 
 
 
455 aa  193  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.93 
 
 
482 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.52 
 
 
481 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.14 
 
 
474 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  38.96 
 
 
594 aa  190  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.78 
 
 
477 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.21 
 
 
475 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  40.07 
 
 
455 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.9 
 
 
492 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.61 
 
 
386 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.35 
 
 
552 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  38.3 
 
 
393 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.43 
 
 
423 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.6 
 
 
545 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  31.85 
 
 
539 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.98 
 
 
478 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.95 
 
 
456 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.91 
 
 
469 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.42 
 
 
508 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  39.66 
 
 
506 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.31 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.75 
 
 
462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.2 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.49 
 
 
474 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  41.05 
 
 
473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.77 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.76 
 
 
502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.78 
 
 
556 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.04 
 
 
483 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.04 
 
 
483 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.05 
 
 
545 aa  183  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  41.11 
 
 
393 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.47 
 
 
506 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.93 
 
 
375 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
389 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.49 
 
 
450 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.38 
 
 
471 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>