More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  100 
 
 
515 aa  998    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  48.86 
 
 
584 aa  319  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  56 
 
 
552 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  55.03 
 
 
575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.98 
 
 
545 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  51.74 
 
 
469 aa  276  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  47.73 
 
 
673 aa  276  7e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  48.1 
 
 
417 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  44.74 
 
 
594 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.99 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.21 
 
 
512 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  48.54 
 
 
423 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.67 
 
 
434 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  47.87 
 
 
517 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.83 
 
 
558 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.85 
 
 
614 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.64 
 
 
420 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  47.98 
 
 
485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.23 
 
 
569 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.37 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.79 
 
 
537 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.26 
 
 
579 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.41 
 
 
506 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.19 
 
 
440 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.67 
 
 
487 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.19 
 
 
440 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.19 
 
 
440 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.44 
 
 
527 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.1 
 
 
417 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.2 
 
 
523 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  42.54 
 
 
539 aa  203  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  44.72 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.21 
 
 
640 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.27 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  43.11 
 
 
511 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.7 
 
 
428 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.94 
 
 
443 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 
349 aa  199  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  41.69 
 
 
489 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  42.91 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  43.22 
 
 
361 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.28 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  43.87 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.09 
 
 
497 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.09 
 
 
674 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.95 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  44.06 
 
 
528 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  38.62 
 
 
418 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.56 
 
 
501 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.14 
 
 
545 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.56 
 
 
501 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  43.57 
 
 
583 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  43.3 
 
 
523 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.6 
 
 
507 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.11 
 
 
485 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.22 
 
 
426 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.22 
 
 
423 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.12 
 
 
476 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.9 
 
 
518 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42.96 
 
 
524 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  42.96 
 
 
524 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  42.11 
 
 
396 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  41.55 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  42.35 
 
 
471 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.84 
 
 
497 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 
456 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.86 
 
 
511 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.05 
 
 
436 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.9 
 
 
486 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  40.69 
 
 
411 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  41.72 
 
 
408 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.9 
 
 
916 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.07 
 
 
453 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  40.35 
 
 
459 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.71 
 
 
483 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.78 
 
 
462 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.74 
 
 
475 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.74 
 
 
475 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.71 
 
 
483 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.61 
 
 
512 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.69 
 
 
471 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.74 
 
 
475 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  42.03 
 
 
468 aa  187  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.25 
 
 
515 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  38.02 
 
 
418 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.2 
 
 
464 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  41.18 
 
 
406 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.53 
 
 
394 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  40.35 
 
 
459 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.76 
 
 
366 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  40 
 
 
453 aa  186  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
496 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 
399 aa  186  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  41.2 
 
 
386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.57 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.49 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.05 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  41.46 
 
 
408 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.45 
 
 
504 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.49 
 
 
388 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>