More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5199 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
640 aa  1217    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  54.04 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.79 
 
 
674 aa  277  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  51.32 
 
 
443 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.61 
 
 
558 aa  257  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.13 
 
 
440 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.13 
 
 
440 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.13 
 
 
440 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.32 
 
 
349 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.31 
 
 
487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  47.08 
 
 
423 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.04 
 
 
512 aa  240  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  50.48 
 
 
464 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.33 
 
 
420 aa  236  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
417 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.26 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.05 
 
 
471 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.72 
 
 
614 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.48 
 
 
524 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.7 
 
 
456 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  48.62 
 
 
575 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.96 
 
 
485 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.33 
 
 
506 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.44 
 
 
518 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.71 
 
 
552 aa  228  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.97 
 
 
497 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.93 
 
 
569 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.64 
 
 
545 aa  223  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.19 
 
 
436 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  39.95 
 
 
584 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.74 
 
 
527 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.28 
 
 
579 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.99 
 
 
501 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.99 
 
 
501 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.54 
 
 
417 aa  217  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.65 
 
 
485 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  42.57 
 
 
489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.38 
 
 
544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.57 
 
 
523 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  46.08 
 
 
597 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.93 
 
 
496 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.46 
 
 
439 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 
475 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 
475 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 
475 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.99 
 
 
497 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.38 
 
 
428 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.82 
 
 
507 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.84 
 
 
434 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  43.96 
 
 
528 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.76 
 
 
426 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.71 
 
 
515 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.21 
 
 
515 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.56 
 
 
511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  44.95 
 
 
469 aa  198  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 
486 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.1 
 
 
545 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  39.8 
 
 
594 aa  195  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  40.65 
 
 
673 aa  195  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3121  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.28 
 
 
359 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 
618 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43 
 
 
483 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.21 
 
 
916 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  43.82 
 
 
393 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43 
 
 
483 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.98 
 
 
517 aa  187  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  38.29 
 
 
409 aa  187  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.07 
 
 
361 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  44.6 
 
 
395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  43.25 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.92 
 
 
283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.88 
 
 
511 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  43.1 
 
 
455 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  41.97 
 
 
400 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.37 
 
 
366 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.85 
 
 
486 aa  184  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.4 
 
 
395 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  44.3 
 
 
456 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  43.1 
 
 
455 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  44.19 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.24 
 
 
500 aa  181  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.87 
 
 
456 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  44.14 
 
 
451 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  44.06 
 
 
476 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 
453 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  43.79 
 
 
450 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  43.79 
 
 
450 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  43.79 
 
 
450 aa  180  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  42.76 
 
 
474 aa  180  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  43.24 
 
 
450 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.76 
 
 
502 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  44.53 
 
 
351 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  41.64 
 
 
361 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  43.57 
 
 
462 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  44 
 
 
424 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  42.76 
 
 
474 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  44.25 
 
 
353 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  42.76 
 
 
474 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  42.76 
 
 
474 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>