More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0507 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 489 aa  954    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.52 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  49.44 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  47.59 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.61 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.86 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  50.32 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.28 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.68 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.19 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.34 
 
 		 614 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  46.91 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.39 
 
 		 569 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.26 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.74 
 
 		 349 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.98 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  43.93 
 
 		 673 aa  228  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 		 640 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.58 
 
 		 674 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.27 
 
 		 428 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.48 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  44.05 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  47.16 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.22 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  47.73 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.88 
 
 		 417 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  44.37 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 		 426 aa  217  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.8 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  46.44 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.35 
 
 		 515 aa  213  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  39.95 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.43 
 
 		 518 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.32 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 		 545 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.21 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 		 417 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.55 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.8 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 		 544 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.78 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.03 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  40.97 
 
 		 578 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.48 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  41.05 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  40.97 
 
 		 588 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.72 
 
 		 498 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.26 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.79 
 
 		 497 aa  190  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  42.6 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  38.27 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  44.21 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  45.39 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  44.21 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  44.37 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  42.81 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  40.69 
 
 		 498 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  38.1 
 
 		 496 aa  186  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  38.48 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  37.99 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.9 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.33 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  37.24 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.79 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.44 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.44 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.83 
 
 		 511 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.7 
 
 		 480 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  38.52 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.47 
 
 		 481 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.34 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.34 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  41.55 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.75 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  41.6 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.19 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  40.36 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  40.36 
 
 		 388 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.29 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  43.46 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  40.36 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  38.78 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  37.64 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.62 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.28 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  34.86 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.1 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>