More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1889 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
515 aa  1021    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.59 
 
 
456 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  68.02 
 
 
440 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  68.02 
 
 
440 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  69.05 
 
 
440 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  61.3 
 
 
464 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.54 
 
 
674 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.92 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  55.41 
 
 
443 aa  302  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.06 
 
 
420 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.93 
 
 
417 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.76 
 
 
640 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  49.53 
 
 
423 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.06 
 
 
512 aa  259  7e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  42.89 
 
 
583 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.66 
 
 
527 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  44.22 
 
 
597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  46.05 
 
 
485 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.13 
 
 
558 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  41.73 
 
 
584 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  46.08 
 
 
537 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.98 
 
 
518 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.84 
 
 
579 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.18 
 
 
569 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.79 
 
 
485 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.29 
 
 
507 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.19 
 
 
417 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.75 
 
 
524 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.59 
 
 
614 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.42 
 
 
434 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.56 
 
 
517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.71 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.27 
 
 
515 aa  213  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  40.65 
 
 
489 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  43.18 
 
 
539 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.64 
 
 
436 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
497 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.82 
 
 
506 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.74 
 
 
486 aa  207  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.73 
 
 
545 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
501 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
501 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
512 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.59 
 
 
497 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.26 
 
 
916 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  45.57 
 
 
575 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
487 aa  203  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 
475 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 
475 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 
475 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.46 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.19 
 
 
428 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  42.42 
 
 
528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.7 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  41.05 
 
 
673 aa  197  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.19 
 
 
544 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.04 
 
 
552 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.4 
 
 
523 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.55 
 
 
426 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.48 
 
 
545 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  39.6 
 
 
594 aa  189  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.23 
 
 
511 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.93 
 
 
483 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.61 
 
 
455 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.93 
 
 
483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  40.12 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  42 
 
 
455 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.65 
 
 
467 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.13 
 
 
456 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.44 
 
 
387 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.36 
 
 
398 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.06 
 
 
556 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.93 
 
 
508 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  40.07 
 
 
393 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  41.61 
 
 
487 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.95 
 
 
283 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  41.61 
 
 
485 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.64 
 
 
361 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  41.67 
 
 
496 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37.28 
 
 
395 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.33 
 
 
401 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  38.19 
 
 
402 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  43.52 
 
 
451 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  38.19 
 
 
388 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  43.52 
 
 
450 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  38.19 
 
 
402 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.02 
 
 
485 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  43.52 
 
 
450 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  43.52 
 
 
450 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  39.08 
 
 
512 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 
423 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.18 
 
 
407 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  41.33 
 
 
474 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  43.19 
 
 
450 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  41 
 
 
474 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.71 
 
 
407 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  37.34 
 
 
508 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.99 
 
 
379 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  37.94 
 
 
402 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>