More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
401 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.57 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.22 
 
 
674 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  52.21 
 
 
443 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  51.34 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.95 
 
 
417 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  44.56 
 
 
464 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  43.61 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42 
 
 
440 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42 
 
 
440 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42 
 
 
440 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.72 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.2 
 
 
527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  49.78 
 
 
583 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.69 
 
 
515 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 
512 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.53 
 
 
456 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  41.64 
 
 
597 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  40 
 
 
584 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.49 
 
 
501 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.49 
 
 
501 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.43 
 
 
497 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.93 
 
 
916 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  38.67 
 
 
489 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
518 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.28 
 
 
475 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.28 
 
 
475 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.28 
 
 
475 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.06 
 
 
640 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.73 
 
 
361 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.58 
 
 
558 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.73 
 
 
349 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 
544 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.5 
 
 
545 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  50.26 
 
 
528 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  47.14 
 
 
575 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.82 
 
 
614 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.74 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.79 
 
 
524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  46.53 
 
 
501 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  46.7 
 
 
515 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.98 
 
 
537 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.97 
 
 
483 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.49 
 
 
485 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.97 
 
 
483 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.63 
 
 
579 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.77 
 
 
487 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.34 
 
 
497 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.97 
 
 
483 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  46.04 
 
 
510 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
471 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  39.79 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.02 
 
 
426 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  43.88 
 
 
500 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  43.88 
 
 
499 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  35.91 
 
 
453 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  45.41 
 
 
505 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  43.88 
 
 
499 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  43.88 
 
 
498 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  43.88 
 
 
498 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  43.88 
 
 
498 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  43.88 
 
 
490 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  45.99 
 
 
496 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.07 
 
 
496 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.81 
 
 
428 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  43.37 
 
 
502 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  43.37 
 
 
502 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  45.41 
 
 
507 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  43.37 
 
 
502 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  43.37 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  43.37 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  43.37 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  45.32 
 
 
518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  43.37 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  43.37 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.22 
 
 
487 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  43.85 
 
 
493 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  43.85 
 
 
487 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  46.28 
 
 
475 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  44.39 
 
 
502 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.07 
 
 
436 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.3 
 
 
556 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.28 
 
 
552 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  48.42 
 
 
453 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43 
 
 
439 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.71 
 
 
545 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  41.45 
 
 
459 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.67 
 
 
511 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  45.45 
 
 
351 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  41.97 
 
 
474 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.97 
 
 
474 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.49 
 
 
492 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.79 
 
 
471 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  45.03 
 
 
464 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  42.78 
 
 
488 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.15 
 
 
392 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.97 
 
 
474 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.32 
 
 
498 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.4 
 
 
509 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  43.32 
 
 
491 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>