99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2599 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
126 aa  248  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  44.17 
 
 
115 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  45.22 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  41.8 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  43.55 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  40.5 
 
 
123 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  37.82 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  41.03 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  42.37 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  47.42 
 
 
109 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  42.24 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  39.84 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  42.73 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  35.54 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  41.41 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  41.41 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  37.41 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  41.86 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  37.07 
 
 
114 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  37.07 
 
 
114 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  38.79 
 
 
109 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  38.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  36.72 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  38.84 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  38.02 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  45.24 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  43.22 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  32.03 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  36.51 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  38.33 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  42.37 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  36.56 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  34.95 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  43.3 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  37.07 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  32.03 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  38.58 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  37.17 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  34.21 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  40.68 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  40.68 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  40.68 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  32.5 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  40.68 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  35.77 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  32.58 
 
 
215 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  31.3 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  39.83 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  36.8 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  38.04 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  38.64 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4330  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  36.9 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  33.93 
 
 
346 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  36.78 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  45.61 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.21 
 
 
1123 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  44.64 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  41.51 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  26.67 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  31.93 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  32.63 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  32.08 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  39.8 
 
 
371 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  26.06 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  29.81 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  39.73 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  39.73 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
141 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  31.09 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  35.06 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  30.67 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>