28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0946 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  62.41 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  62.17 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  42.91 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  32.34 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  28.95 
 
 		 395 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  29.84 
 
 		 434 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.06 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  33.13 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  31.82 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1052 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  24.48 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.95 
 
 		 1842 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.34 
 
 		 1518 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  25.25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.22 
 
 		 1732 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1055 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 589 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  34.38 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1247 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.33 
 
 		 1882 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  27.97 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  25.53 
 
 		 456 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.96 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  26.73 
 
 		 476 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  25.54 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  27.52 
 
 		 2495 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>