47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1195 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  100 
 
 
1247 aa  2491    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  26.35 
 
 
1882 aa  258  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  23.76 
 
 
1518 aa  191  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.52 
 
 
1842 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  26.32 
 
 
460 aa  148  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.3 
 
 
1732 aa  139  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  23.37 
 
 
2495 aa  127  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.89 
 
 
355 aa  116  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.41 
 
 
1052 aa  115  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  36.48 
 
 
2392 aa  110  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  32.22 
 
 
395 aa  103  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  32.78 
 
 
361 aa  102  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  25.6 
 
 
1118 aa  89.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  28.91 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  22.52 
 
 
730 aa  81.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  29.95 
 
 
476 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  32.09 
 
 
320 aa  77.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  23.31 
 
 
1055 aa  76.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  24.46 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
589 aa  75.1  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  23.79 
 
 
456 aa  67.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  26.4 
 
 
352 aa  67.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  35.53 
 
 
225 aa  66.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35 
 
 
691 aa  65.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30.4 
 
 
434 aa  63.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  28.48 
 
 
254 aa  62  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.67 
 
 
231 aa  59.7  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.46 
 
 
657 aa  57.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  33.59 
 
 
2031 aa  55.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
399 aa  53.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  27.34 
 
 
313 aa  53.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  23.67 
 
 
278 aa  52.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  36.14 
 
 
380 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  31.62 
 
 
203 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  31.03 
 
 
237 aa  50.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  52.27 
 
 
268 aa  49.7  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  31.03 
 
 
213 aa  49.3  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.39 
 
 
407 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  32.88 
 
 
578 aa  47.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  34.43 
 
 
297 aa  48.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  30.16 
 
 
290 aa  48.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  24.12 
 
 
275 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  23.44 
 
 
538 aa  47  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  31.15 
 
 
987 aa  47.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  30.7 
 
 
269 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  27.64 
 
 
506 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>