24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2852 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  100 
 
 
1118 aa  2252    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  26.48 
 
 
1882 aa  95.9  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.24 
 
 
1518 aa  84  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  23.11 
 
 
1732 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  23.71 
 
 
1055 aa  83.2  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  23.22 
 
 
1842 aa  84  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24.25 
 
 
1247 aa  83.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  25.14 
 
 
2495 aa  76.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  28.7 
 
 
355 aa  74.3  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  24.51 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  30.9 
 
 
352 aa  66.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  24.13 
 
 
460 aa  63.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  23 
 
 
1052 aa  63.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  30.72 
 
 
2392 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
589 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  22.68 
 
 
730 aa  59.3  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  25.08 
 
 
476 aa  57.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
399 aa  54.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  25.66 
 
 
395 aa  54.3  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.73 
 
 
285 aa  53.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  26.9 
 
 
290 aa  52.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  25.23 
 
 
361 aa  51.6  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  25.65 
 
 
293 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  29.37 
 
 
237 aa  45.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>