40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0421 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  100 
 
 
1055 aa  2160    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.96 
 
 
2495 aa  158  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  26.53 
 
 
456 aa  146  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
589 aa  127  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  28.88 
 
 
352 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
399 aa  112  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  23.7 
 
 
1882 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  22.8 
 
 
1842 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  25.16 
 
 
1518 aa  91.7  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  29.6 
 
 
293 aa  88.2  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  30.6 
 
 
290 aa  88.2  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  25.89 
 
 
538 aa  85.5  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  23.76 
 
 
1118 aa  82.8  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  30.32 
 
 
203 aa  79  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  23.31 
 
 
1247 aa  75.5  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  31.65 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  22.84 
 
 
1052 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  25.39 
 
 
395 aa  70.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.61 
 
 
285 aa  66.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  21.32 
 
 
1732 aa  65.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  23.93 
 
 
460 aa  65.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  28.26 
 
 
355 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  21.17 
 
 
730 aa  62  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.34 
 
 
2392 aa  59.7  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  30.37 
 
 
269 aa  59.3  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  30.33 
 
 
254 aa  58.9  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.86 
 
 
361 aa  58.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  22.47 
 
 
458 aa  55.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  33.33 
 
 
657 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  34.34 
 
 
269 aa  52  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  29.87 
 
 
380 aa  51.6  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  28.48 
 
 
1017 aa  51.6  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.05 
 
 
476 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.28 
 
 
231 aa  51.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  23.81 
 
 
734 aa  48.5  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  32.43 
 
 
275 aa  48.5  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  25.27 
 
 
270 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  24.48 
 
 
691 aa  46.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30 
 
 
434 aa  45.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  35.06 
 
 
297 aa  44.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>