48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0278 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  100 
 
 
352 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  52.46 
 
 
456 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  51.05 
 
 
589 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  49.65 
 
 
399 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  42.15 
 
 
293 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  42.4 
 
 
395 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.5 
 
 
1882 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  51.7 
 
 
237 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  48.6 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  58.65 
 
 
203 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.79 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  35.29 
 
 
1052 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.71 
 
 
2495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  42.86 
 
 
1842 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  59.43 
 
 
269 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  32.73 
 
 
458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  26.9 
 
 
1055 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  27.91 
 
 
538 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  26.69 
 
 
1732 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  29.59 
 
 
476 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  31.62 
 
 
730 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  34.12 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  32.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  40.71 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  27.76 
 
 
1518 aa  80.1  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  56.41 
 
 
109 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  32.57 
 
 
1017 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  33.88 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  30.3 
 
 
2392 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  30.7 
 
 
691 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  27.38 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.51 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24 
 
 
1247 aa  66.2  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  30.9 
 
 
1118 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  37.06 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  27.65 
 
 
225 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.78 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  27.97 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  27.22 
 
 
271 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  22.37 
 
 
213 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  38.17 
 
 
434 aa  50.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  38.03 
 
 
297 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  30.19 
 
 
734 aa  46.2  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  22.92 
 
 
158 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2457  hypothetical protein  29.17 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.982376  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.8 
 
 
657 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  25.54 
 
 
275 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  18.06 
 
 
1331 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>