58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1660 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  100 
 
 		 1518 aa  3081    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  30.92 
 
 		 1882 aa  324  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24 
 
 		 1247 aa  185  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.36 
 
 		 460 aa  172  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.86 
 
 		 1842 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  37.93 
 
 		 355 aa  165  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1052 aa  159  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.29 
 
 		 1732 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  23.62 
 
 		 2495 aa  145  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  30.32 
 
 		 395 aa  141  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  33.94 
 
 		 285 aa  127  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  26.88 
 
 		 458 aa  124  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.1 
 
 		 476 aa  121  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  24.38 
 
 		 730 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.91 
 
 		 2392 aa  119  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  27.34 
 
 		 456 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 399 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  30.56 
 
 		 361 aa  103  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1055 aa  93.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1118 aa  84.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  24.19 
 
 		 848 aa  82.4  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  26.12 
 
 		 663 aa  81.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  25.07 
 
 		 760 aa  81.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.76 
 
 		 352 aa  80.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  30.16 
 
 		 254 aa  79.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  28.17 
 
 		 538 aa  76.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  28.4 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  73.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 589 aa  74.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  26.9 
 
 		 691 aa  72  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  29.03 
 
 		 231 aa  72  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  71.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  32.24 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  30.41 
 
 		 278 aa  64.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  29.38 
 
 		 271 aa  63.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  26.43 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  25.27 
 
 		 772 aa  62.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.45 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  32.98 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  28.34 
 
 		 290 aa  61.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  28.75 
 
 		 270 aa  61.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  28.48 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  58.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  28 
 
 		 225 aa  57  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  32.22 
 
 		 158 aa  55.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  29.14 
 
 		 434 aa  55.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  25.7 
 
 		 382 aa  52.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2031 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  22.66 
 
 		 414 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  26.26 
 
 		 460 aa  50.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  22.88 
 
 		 710 aa  50.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  26.34 
 
 		 275 aa  49.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10516  SCF E3 ubiquitin ligase complex F-box protein grrA (SCF substrate adapter protein grrA)(F-box and leucine-rich repeat protein grrA)(F-box/LRR-repeat protein grrA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q15I80]  22 
 
 		 585 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000155754  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  34.33 
 
 		 269 aa  46.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  38.6 
 
 		 213 aa  45.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  28.45 
 
 		 286 aa  45.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>