43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2835 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 399 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  47.94 
 
 		 456 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  42.09 
 
 		 589 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  49.65 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  51.48 
 
 		 237 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  40.95 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.27 
 
 		 1882 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.09 
 
 		 2495 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.51 
 
 		 1052 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  42.55 
 
 		 293 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  35.16 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.85 
 
 		 1842 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  47.3 
 
 		 203 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.22 
 
 		 1732 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1055 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.87 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  28.22 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  24.67 
 
 		 1518 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  25.68 
 
 		 730 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  49.5 
 
 		 269 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  30.5 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.82 
 
 		 2392 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.88 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  26.77 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  32.33 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  31.07 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  28.73 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.04 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.81 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  32.93 
 
 		 1017 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  23.88 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1247 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  42.31 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  30.09 
 
 		 657 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1331 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  19.05 
 
 		 1266 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  32.93 
 
 		 109 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  27.21 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1323 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  26.92 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>