43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3469 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  48.33 
 
 		 456 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  45.02 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  41.23 
 
 		 399 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  44.71 
 
 		 589 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  41.52 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  48.33 
 
 		 352 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  39.18 
 
 		 2495 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  42.44 
 
 		 203 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.33 
 
 		 1842 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  45.06 
 
 		 1882 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  38.27 
 
 		 395 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  46.36 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  35.34 
 
 		 1017 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  32.05 
 
 		 1052 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  29 
 
 		 1055 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  34.27 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  35.38 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  32.06 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.79 
 
 		 2392 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  33.78 
 
 		 1732 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  27.68 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  31.39 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.2 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  36.03 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  32.82 
 
 		 730 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.34 
 
 		 1518 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  26.52 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.32 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  34.69 
 
 		 109 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  32.84 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  32.58 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  31.08 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  31.54 
 
 		 434 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1247 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  25.57 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  29.02 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  30.3 
 
 		 657 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  25.95 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  25.57 
 
 		 691 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  25.93 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>